分子動力学における遷移経路サンプリングのための生成法【JST・京大機械翻訳】

Lelievre Tony; Robin Genevieve; Sekkat Inass; Stoltz Gabriel; Cardoso Gabriel Victorino

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202221143659020 整理番号：22P0344963

分子動力学における遷移経路サンプリングのための生成法【JST・京大機械翻訳】

Generative methods for sampling transition paths in molecular dynamics

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発行年： 2022年05月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2023年01月31日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

分子系は,準安定性として知られる他の1つの挙動に切り替える前に,ポテンシャルエネルギー関数のいくつかの局所最小値の周りで長時間トラップされることが多い。1つの準安定状態をもう1つに連結するシミュレーション遷移経路は,直接数値法によって困難である。機械学習技法の有望性を考慮して,本研究では,遷移経路を効率的に生成するための2つのアプローチ,すなわち,変分オートエンコーダのような生成モデルに基づくサンプリング法,および強化学習に基づく重要度サンプリング法を検討した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

反応速度論・触媒一般 , 分子・遺伝情報処理

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