プレプリント
J-GLOBAL ID:202202221242730659   整理番号:21P0258246

ssGBLUPによるその後の遺伝的評価に対するゲノム前選択の影響-ブタからの実データの利用【JST・京大機械翻訳】

Impact of genomic preselection on subsequent genetic evaluations with ssGBLUP - using real data from pigs
著者 (6件):
資料名:
発行年: 2022年01月25日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年01月25日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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【背景】事前選択動物のその後の遺伝的評価に及ぼす事前選択の影響を評価するには,事前選択のないシナリオを含む異なるアプローチを考慮したシナリオの比較が必要である。しかし,事前選択は動物育種プログラムにおいてほとんど常に起こるので,事前選択のないデータセットを持つのは難しい。したがって,事前選択に関するほとんどの研究は,その後の単一段階ゲノム最良線形不偏予測(ssGBLUP)評価からのゲノム推定育種価(GEBV)が不偏であると結論づける。本研究の目的は,市販ブタ育種プログラムからのデータを用いて,その後のssGBLUP評価の精度とバイアスに対するゲノム前選択(GPS)の影響を検討することである。方法:著者らは,1つの父親系統と1つのダム系統からの4つのブタ生産形質に関するデータを使用した。形質は,性能試験中の平均日増,寿命中の平均日増,背脂肪厚,およびロイン深さである。これらの形質が2系統の育種目標において異なる重さを持つので,著者らは別々に2つの系統を分析した。ラインでは,次の2つのシナリオを比較したすべての利用可能なデータを維持する参照GPSシナリオがあった。次に,検証世代のみ,またはii)全世代において,子孫を何れも除くことなく,GPSの付加的層を有する2つの他のシナリオを実装した。GPSシナリオを実施後に残ったすべてのデータを利用して,GPSシナリオにつき次のssGBLUP評価を行った。計算精度とバイアスにおいて,検証動物の子孫収量偏差に対するGEBVを比較した。結果:両系統の全ての形質の結果は,GPSの付加的層により,精度に限界損失を示した。両系統におけるすべてのGPSシナリオにわたる平均精度は,本研究で考慮した4つの形質に対して,それぞれ0.39,0.47,0.56および0.60であった。Biasは大部分が存在せず,対応するGPSシナリオ間では大きな違いがなかった。結論:前選択は一般的に動物育種プログラムにおいて同じ効果を持つので,著者らは,前選択の影響は,ブタおよびその他の動物育種プログラムにおける選択候補のその後のssGBLUP評価における精度およびバイアスに関して一般的に最小であると結論した。【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (2件):
分類
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飼育動物の育種  ,  牛 
タイトルに関連する用語 (3件):
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