ヒトディジタルツイン:多重皮膚生検における自動細胞型距離計算と3Dアトラス構築【JST・京大機械翻訳】

Ghose, S.; Ju, Y.; McDonough, E.; Ho, J.; Karunamurthy, A.; Chadwick, C.; Cho, S.; Rose, R.; Corwin, A.; Surrette, C.; Martinez, J. S.; Williams, E.; Sood, A.; Al-Kofahi, Y.; Falo, L. D.; Borner, K.; Ginty, F.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202221269544989 整理番号：22P0326063

ヒトディジタルツイン:多重皮膚生検における自動細胞型距離計算と3Dアトラス構築【JST・京大機械翻訳】

Human Digital Twin: Automated Cell Type Distance Computation and 3D Atlas Construction in Multiplexed Skin Biopsies

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発行年： 2022年03月30日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月30日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

三次元(3D)における単一細胞解像度での人体のマッピングは,細胞-細胞相互作用の重要な構造と動力学を捕捉する「ディジタルツイン」モデルに向けた重要なステップである。現在の3Dイメージング法は低解像度に悩まされ,細胞型とそれらの空間的関係を識別する能力に限定されている。新しい3Dワークフロー:MATRICS-A(Multiplexed Image 3D再構成と統合細胞空間-Analysis)を提示し,多重画像からの細胞の3Dマップを生成し,内皮細胞からの細胞型距離と興味の他の特徴を計算した。著者らは,異なる太陽曝露効果(軽度,中等度マーク)を有する10の解剖学的領域からの生検で,若年および高齢ドナー(n=10;33~72歳)からの逐次皮膚切片からの多重データにこのワークフローを適用した。各試料からの26の連続した切片は,12の細胞型(ケラチン細胞(顆粒,棘,基底),上皮と筋上皮細胞,線維芽細胞,マクロファージ,Tヘルパー,Tキラー,Tregs,ニューロンと内皮細胞,DNA損傷と修復(p53,DDB2)と細胞増殖(Ki67)のマーカーをカバーする18のバイオマーカーによる多重イメージングを受けた。細胞分類に続いて,組織と分類された細胞を3D容積に再構成した。DDB2陽性細胞と年齢との間に有意な逆相関が見られた(corr=-0.78,adj.p=0.047)。これは,非癌高齢太陽曝露個人における修復能力の低下を示唆する。絶対免疫細胞数は年齢または太陽曝露によって異ならなかったが,T Helper/T Killer細胞の比率は年齢と正相関し(r=0.82,adj.p=0.048),これは皮膚における最初のそのような3D研究であり,皮膚および他の器官における老化および疾患におけるより多くの細胞型および空間的関係のカタログ化のための道を開いた。【JST・京大機械翻訳】

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植物形態学・解剖学 , 光学的測定とその装置一般

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