アクチンフィラメントの伸張,曲げ,せん断およびねじれについて  II:多重分解能モデリング【JST・京大機械翻訳】

Gunaratne Ravinda; Floyd Carlos; Ni Haoran; Papoian Garegin A.; Erban Radek

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202221348781864 整理番号：22P0297934

アクチンフィラメントの伸張,曲げ,せん断およびねじれについて II:多重分解能モデリング【JST・京大機械翻訳】

On Stretching, Bending, Shearing and Twisting of Actin Filaments II: Multi-Resolution Modelling

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発行年： 2022年03月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月02日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

F-アクチンフィラメントをモデル化するための多重解像度方法論を提示した。それは,ロッドベースの巨視的モデルによって,シミュレートしたフィラメントの一部で単量体ベースのモデルを置き換えることによって,より低い計算コストで個々のモノマーのレベルの詳細な顕微鏡的情報を提供する。単量体に基づく記述において,G-アクチンは二重螺旋構造で表面に結合した楕円体によって表現され,F-アクチンを形成する。ロッドベースモデルはより粗く,F-アクチンはCosseratモデルを用いて記述され,先行論文[arXiv:2112.01480]で見られた。延伸,曲げ,せん断およびねじりの下でのF-アクチンの特性を試験するために設計した3つの事例研究を用いて,多重解像度方法論を説明した。この方法は,フィラメントが曲げ変形を受ける状況に特に適している。F-アクチンの完全ねじり挙動を把握するための標準Cosseratモデルの使用の限界を検討し,曲率依存剛性とねじり-伸張結合を説明する拡張を示し,全体的多重解像度スキームの精度を改善した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子構造 , 細胞構成体一般

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