トランスポゾン変異誘発とハイスループット配列決定(TnSeq)を用いた枯草菌の遊走運動性に必要な遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Sanchez, S.; Snider, E. V.; Wang, X.; Kearns, D. B.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202221390458771 整理番号：22P0317455

トランスポゾン変異誘発とハイスループット配列決定(TnSeq)を用いた枯草菌の遊走運動性に必要な遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of genes required for swarming motility in Bacillus subtilis using transposon mutagenesis and high-throughput sequencing (TnSeq)

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発行年： 2022年03月08日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月08日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Bacillus subtilisは,表面運動性の鞭毛媒介型であるスウォーミング運動性を示す。ここでは,ハイスループットトランスポゾン変異誘発および配列決定(TnSeq)を用い,スウォーミングに必要な候補遺伝子を同定した。TnSeq法は鞭毛生合成に必要な既知遺伝子の全てと,スウォーミングを促進する既報の調節因子のほとんど全てを同定した。さらに,スウォーミングを改善し,それらを個別に検証した付加的36遺伝子を同定した。これらのうち,重度の欠損を有する2つの突然変異体は,鞭毛生合成に必要なfliTと,その欠損が鞭毛の欠如に起因できない未知の機能yolBの遺伝子を含む,回復した。本研究は,TnSeqがプレート上のコロニーの外向きの拡大を駆動する運動性に必要な遺伝子の同定のための強力なアプローチであることを示す。IMPORTANCEIn TnSeq,トランスポゾンは,集団レベルで染色体全体にランダムに挿入されるが,必須機能の遺伝子を破壊する挿入は,集団から脱落し,配列レベルで過小表示される菌株を引き起こす。ここでは,B.subtilisにおける運動性の非必須表現型にTnSeqを適用し,スウォーミングにおいて,空間的に選択した細胞に対して空間的に選択した。スウォーミングに必要なと同定されたほぼ全ての遺伝子における挿入はTnSeq解析で過小表現され,スウォーミングを増強する36の付加的遺伝子を同定した。著者らは,TnSeqが運動性の遺伝分析のための強力なツールであり,その濃縮が強い他の非致死性スクリーニングであることを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子・遺伝情報処理 , 遺伝子の構造と化学 , 遺伝子操作

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