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J-GLOBAL ID:202202222175816854   整理番号:22A1074587

機械学習によるタンパク質のアポ構造からホロ構造の予測手法の開発

Development of prediction method of holo-structure from apo-structure of protein by machine learning
著者 (3件):
資料名:
巻: 2022  号: BIO-69  ページ: Vol.2022-BIO-69,No.6,1-6 (WEB ONLY)  発行年: 2022年03月03日 
JST資料番号: U0451A  資料種別: 会議録 (C)
記事区分: 原著論文  発行国: 日本 (JPN)  言語: 日本語 (JA)
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分類 (2件):
分類
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分子・遺伝情報処理  ,  人工知能 
引用文献 (18件):
  • Daniel Seeliger and Bert L De Groot. Conformational transitions upon ligand binding: holo-structure prediction from apo conformations. PLoS computational biology, Vol. 6, No. 1, p. e1000634, 2010.
  • Peter Cimermancic, Patrick Weinkam, T Justin Rettenmaier, Leon Bichmann, Daniel A Keedy, Rahel A Woldeyes, Dina Schneidman-Duhovny, Omar N Demerdash, Julie C Mitchell, James A Wells, et al. Cryptosite: expanding the druggable proteome by characterization and prediction of cryptic binding sites. Journal of molecular biology, Vol. 428, No. 4, pp. 709-719, 2016.
  • Manfred Hendlich, Friedrich Rippmann, and Gerhard Barnickel. Ligsite: automatic and efficient detection of potential small molecule-binding sites in proteins. Journal of Molecular Graphics and Modelling, Vol. 15, No. 6, pp. 359-363, 1997.
  • Takeshi Kawabata. Detection of multiscale pockets on protein surfaces using mathematical morphology. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Vol. 78, No. 5, pp. 1195-1211, 2010.
  • Phillip Isola, Jun-Yan Zhu, Tinghui Zhou, and Alexei A Efros. Image-to-image translation with conditional adversarial networks. In Proceedings of the IEEE conference on computer vision and pattern recognition, pp.1125-1134, 2017.
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タイトルに関連する用語 (4件):
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