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J-GLOBAL ID:202202224085964130   整理番号:22A1057351

単一ヌクレオチド多型の大規模並列配列決定データに関する線形回帰とニューラルネットワークを用いたDNA混合物解釈【JST・京大機械翻訳】

DNA mixture interpretation using linear regression and neural networks on massively parallel sequencing data of single nucleotide polymorphisms
著者 (13件):
資料名:
巻: 54  号:ページ: 150-162  発行年: 2022年 
JST資料番号: T0260A  ISSN: 0045-0618  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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質量分析(MPS)は,複数の一塩基多型(SNP)の同時解析と,極めて不均衡なDNA混合物へのマイナーな寄与因子からの対立遺伝子の検出を可能にする。DNA混合物から得られた複雑なMPSデータを解釈するために,EuroForMix,線形回帰,およびニューラルネットワークモデルを採用した。10の単一ソースDNA試料のMPSを通して配列された960の常染色体SNPsのデータ,非相対的(混合物比率1:29-1:99)からの26の非分解DNA混合物,相対物(1:29-1:99)からの16の非分解DNA混合物,非相対的(1:29-1:99)からの8つの分解DNA混合物,および相対的(1:29-1:99)の16の分解したDNA混合物を分析した。全体で,89.4%(59/66),93.9%(62/66)のDNA混合物への寄与は,それぞれEuroForMix,線形回帰,およびニューラルネットワークを用いて正確に推論できた。結論として,線形回帰およびニューラルネットワークモデルは,MPSデータからのDNA混合物に対するマイナーな寄与因子の決定において,EuroForMixを凌駕した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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脳・神経系モデル 

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