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J-GLOBAL ID：202202229521213057   整理番号：22A1178636

トランスクリプトームおよび創薬解析は癌における有望なアジュバント治療としてのKDM4サブファミリーを標的とする天然化合物を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic and Drug Discovery Analyses Reveal Natural Compounds Targeting the KDM4 Subfamily as Promising Adjuvant Treatments in Cancer

著者 (6件)： del Moral-Morales Aylin (1Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autonoma Metropolitana-Cuajimalpa (UAM-C), Mexico City, Mexico) ,  Salgado-Albarran Marisol (1Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autonoma Metropolitana-Cuajimalpa (UAM-C), Mexico City, Mexico) ,  Salgado-Albarran Marisol (2Chair of Experimental Bioinformatics, TUM School of Life Sciences Weihenstephan, Technical University of Munich, Munich, Germany) ,  Ortiz-Gutierrez Elizabeth (1Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autonoma Metropolitana-Cuajimalpa (UAM-C), Mexico City, Mexico) ,  Perez-Hernandez Gerardo (1Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autonoma Metropolitana-Cuajimalpa (UAM-C), Mexico City, Mexico) ,  Soto-Reyes Ernesto (1Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autonoma Metropolitana-Cuajimalpa (UAM-C), Mexico City, Mexico)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 860924  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： KDM4蛋白質は,ヒストンH3のリジン9および36のトリメチル化を標的とするヒストンデメチラーゼのサブファミリーであり,それぞれ転写抑制および伸長と関連する。癌におけるそれらの脱調節はクロマチン構造変化と悪性を促進する転写欠損につながる可能性がある。KDM4蛋白質は癌治療における有望な薬物標的であるが,少数の薬物のみがこれらの酵素の阻害剤として記述されているが,可能な阻害剤としての天然化合物に関する研究はまだ必要である。天然化合物は生物活性物質の主要な供給源であり,多くのものはDNAメチル化やヒストン脱アセチル化などのエピジェネティック過程を標的とすることが知られており,新しいヒストンデメチラーゼ阻害剤の発見のための豊富な供給源となっている。ここでは,トランスクリプトミクス解析を用いて,KDM4ファミリーが脱調節され,複数の腫瘍組織で予後不良と関連することを明らかにした。また,分子ドッキングおよび分子動力学アプローチにより,FDA承認薬および薬物Bankデータベースと比較して天然起源の阻害剤を探索するためにCOCONUTデータベースをスクリーニングした。天然物からの分子はFREDドッキング分析において最良のスコアを示した。糖,芳香環,およびOHまたはO基の存在がKDM4サブファミリー蛋白質の活性部位との相互作用に有利であった。最後に,蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークを統合し,トランスクリプトミクス分析とドッキングスクリーニングからのデータを相関させ,マルチターゲット療法として,またはKDM4酵素の潜在的天然阻害剤と組み合わせたFDA承認薬を提案した。この研究は,癌におけるKDM4ファミリーの関連性を明らかにし,可能性のある治療として使用できる天然化合物を提案する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ターゲット ,  データベース ,  ネットワーク ,  ドッキング ,  酵素 ,  転写【遺伝】 ,  薬物 ,  活性部位 ,  N-メチルアミノ酸オキシダーゼ ,  スクリーニング ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  *創薬 ,  癌治療 ,  ヒストンデメチラーゼ ,  *天然化合物 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： エピジェネティクス(クロマチンリモデリング) ,  KDM4阻害剤 ,  癌 ,  天然化合物 ,  薬物発見 ,  構造生物学

分類 (1件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

引用文献 (93件)：

• AbrahamM. J., MurtolT., SchulzR., PállS., SmithJ. C., HessB., et al (2015). GROMACS: High Performance Molecular Simulations through Multi-Level Parallelism from Laptops to Supercomputers. SoftwareX 1-2, 19-25. doi: 10.1016/j.softx.2015.06.001
• AggerK., NishimuraK., MiyagiS., MesslingJ.-E., RasmussenK. D., HelinK. (2019). The KDM4/JMJD2 Histone Demethylases Are Required for Hematopoietic Stem Cell Maintenance. Blood 134 (14), 1154-1158. doi: 10.1182/blood.2019000855
• AlcarazN., HartebrodtA., ListM. (2020). De Novo Pathway Enrichment with KeyPathwayMiner. Methods Mol. Biol. 2074, 181-199. doi: 10.1007/978-1-4939-9873-9_14
• BabyS., ValapilD. G., ShankaraiahN. (2021). Unravelling KDM4 Histone Demethylase Inhibitors for Cancer Therapy. Drug Discov. Today 26 (8), 1841-1856. doi: 10.1016/j.drudis.2021.05.015
• BavetsiasV., LaniganR. M., RudaG. F., AtrashB., McLaughlinM. G., TumberA., et al (2016). 8-Substituted Pyrido[3,4-D]pyrimidin-4(3h)-One Derivatives as Potent, Cell Permeable, KDM4 (JMJD2) and KDM5 (JARID1) Histone Lysine Demethylase Inhibitors. J. Med. Chem. 59 (4), 1388-1409. doi: 10.1021/acs.jmedchem.5b01635

タイトルに関連する用語 (10件)： トランスクリプトーム ,  創薬 ,  解析 ,  癌 ,  アジュバント ,  治療 ,  サブ ,  ファミリー ,  標的 ,  天然化合物