文献

J-GLOBAL ID：202202231035765280   整理番号：22A0106685

トランスクリプトミクスデータから推測されるPodocarpus科の系統発生と進化に関する新しい洞察【JST・京大機械翻訳】

New insights into the phylogeny and evolution of Podocarpaceae inferred from transcriptomic data

著者 (7件)： Chen Luo (State Key Laboratory of Systematic and Evolutionary Botany, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093, China) ,  Chen Luo (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Jin Wei-Tao (State Key Laboratory of Systematic and Evolutionary Botany, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093, China) ,  Liu Xin-Quan (State Key Laboratory of Systematic and Evolutionary Botany, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093, China) ,  Liu Xin-Quan (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Wang Xiao-Quan (State Key Laboratory of Systematic and Evolutionary Botany, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093, China) ,  Wang Xiao-Quan (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 166  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分類群数の増加は系統ゲノミクスの開発により解決されてきた。しかし,Podcarpaceaeの遺伝子間関係,すなわち19属から成る針葉樹の2番目に大きいファミリー,および主に南半球に分布する約187の種は,ゲノム規模のデータセットが使用された時でさえ,以前の研究ではよく解かれていない。ここでは,Podcarpaceaeとその姉妹群Araucariaceaeの47のトランスクリプトームから発生した993の核オルソロガス群(OG)と54の葉緑体OG(遺伝子)を用いて,Podcarpaceaeの系統発生を再構築した。本研究は,全ての現存属によって代表されるPodcarpaceaeの遺伝子間関係を完全に解決し,系統樹間のトポロジー的対立が同義置換に起因することを明らかにした。さらに,著者らは,2つの形態学的形質,果肉種子円錐および扁平葉が,被子植物支配森林に順応するPodcarpaceaeにとって重要であり,従って,その種の多様化を促進する可能性があることを見出した。さらに,我々の結果は,Podcarpaceaeが三畳紀後期にゴンドワナに起源し,ビカリアンスと分散の両方が現在の生物地理学的パターンに寄与していることを示す。本研究は,このファミリーの将来の研究に重要な進化フレームワークであるPodcarpaceaeの最初のロバストなトランスクリプトームに基づく系統発生を提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 位相幾何学 ,  遺伝子 ,  被子植物 ,  系統樹 ,  *系統発生 ,  果肉 ,  南半球 ,  *マキ属 ,  針葉樹 ,  ロバスト性 ,  モルフォロジー ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  同義置換 ,  分類群 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Podocarpusaceae ,  系統ゲノミクス ,  生物地理学 ,  形態学的特徴進化 ,  ゴンドワナ

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  動物分類学  (EJ01030T)

タイトルに関連する用語 (6件)： トランスクリプトミクス ,  推測 ,  Podocarpus ,  系統発生 ,  進化 ,  洞察