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J-GLOBAL ID：202202231182233648   整理番号：22A0225576

植物由来ペプチドを用いたSARS-CoV-2からのパパイン様プロテアーゼ阻害のin silico解析【JST・京大機械翻訳】

In Silico Analysis of Inhibiting Papain-like Protease from SARS-CoV-2 by Using Plant-Derived Peptides

著者 (7件)： Moradi Mohammad (Molecular Biology Research Center, Systems Biology and Poisonings Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Moradi Mohammad (Department of Biotechnology, Faculty of Biological Science and Technology, University of Isfahan, Isfahan, Iran) ,  Golmohammadi Reza (Molecular Biology Research Center, Systems Biology and Poisonings Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Najafi Ali (Molecular Biology Research Center, Systems Biology and Poisonings Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Moosazadeh Moghaddam Mehrdad (Applied Biotechnology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Fasihi-Ramandi Mahdi (Molecular Biology Research Center, Systems Biology and Poisonings Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Mirnejad Reza (Molecular Biology Research Center, Systems Biology and Poisonings Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran)
資料名： International Journal of Peptide Research and Therapeutics  (International Journal of Peptide Research and Therapeutics)
巻： 28  号： 1  ページ： 24  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4483A  ISSN： 1573-3904  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： SARS-CoV-2は,2019年以降始まった歴史の死んだ流行の1つの原因であるコロナウイルスである。SARS-CoV-2における臨界酵素の活性の抑制は,ウイルスライフサイクルにおける重要な段階を潜在的に阻害することができた。パパイン様プロテアーゼ(PLpro)は,SARS-CoV-2のウイルス複製における重要な酵素とみなすことができた。本研究では,潜在的植物由来プロテアーゼ阻害剤ペプチドを用いて,PLpro酵素の活性を抑制することを目的とした。この目的のために,プロテアーゼ活性を阻害する可能性のある11の植物由来ペプチドを文献から選択した。PLproとペプチドリガンドの構造をPDB(蛋白質データバンク)から取得し,構造最適化後,HADDOCK2.4プログラムを用いてドッキングした。結果は,Veronica hederifoliaからのVcTIが,PLproのライアなZn部位と古典的な活性部位の両方で,効果的な分子相互作用を提供し,SARS-CoV-2の複製を停止するのに使用できるこの酵素の有望な阻害リガンドになることを示す。分子動力学シミュレーションは,選択した受容体とリガンド複合体が安定であることを確認した。SARS-CoV-2感染に対する潜在的治療としてこの化合物の効率を検証するために,将来のin vitroおよびin vivo調査が必要である。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature B.V. 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子間相互作用 ,  ライフサイクル ,  酵素 ,  *ペプチド ,  *パパイン ,  活性部位 ,  臨界 ,  複合体 ,  *ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  ウイルス複製 ,  プロテイナーゼ阻害剤 ,  in vitro実験
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  *重症急性呼吸器症候群 ,  分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 植物由来ペプチド ,  in silico ,  SARS-CoV-2 ,  パパイン様プロテアーゼ

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (7件)： 植物 ,  ペプチド ,  SARS-CoV-2 ,  パパイン ,  プロテアーゼ ,  阻害 ,  解析