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J-GLOBAL ID：202202251662118084   整理番号：22A3154371

下垂体腺腫の大規模コホートにおけるRT-qPCR分析のための信頼できる参照遺伝子の選択と検証【JST・京大機械翻訳】

Selection and validation of reliable reference genes for RT-qPCR analysis in a large cohort of pituitary adenomas

著者 (14件)： Normann Kjersti Ringvoll (Section of Specialized Endocrinology, Department of Endocrinology, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Normann Kjersti Ringvoll (Institute of Clinical Medicine, Faculty of Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Normann Kjersti Ringvoll (Research Institute for Internal Medicine, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Oystese Kristin Astrid Berland (Section of Specialized Endocrinology, Department of Endocrinology, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Oystese Kristin Astrid Berland (Institute of Clinical Medicine, Faculty of Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Berg Jens Petter (Institute of Clinical Medicine, Faculty of Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Berg Jens Petter (Department of Medical Biochemistry, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Lekva Tove (Research Institute for Internal Medicine, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Berg-Johnsen Jon (Institute of Clinical Medicine, Faculty of Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Berg-Johnsen Jon (Department of Neurosurgery, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Bollerslev Jens (Section of Specialized Endocrinology, Department of Endocrinology, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Bollerslev Jens (Institute of Clinical Medicine, Faculty of Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Olarescu Nicoleta Cristina (Section of Specialized Endocrinology, Department of Endocrinology, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Olarescu Nicoleta Cristina (Research Institute for Internal Medicine, Oslo University Hospital, Oslo, Norway)
資料名： Molecular and Cellular Endocrinology  (Molecular and Cellular Endocrinology)
巻： 437  ページ： 183-189  発行年： 2016年 
JST資料番号： D0025B  ISSN： 0303-7207  CODEN： MCEND6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： リアルタイム逆転写定量的PCR(RT-qPCR)は,遺伝子発現変化の定量化のための選択の方法になった。RT-qPCRの最も重要な限界は不適切なデータ正規化と矛盾したデータ解析である。下垂体腺腫は一般的な腫瘍であり,この分野におけるますます公表されているデータの適切な解釈は,安定に発現された参照遺伝子の適切な選択と検証の欠如によって妨げられる。非機能(NFPA)およびホルモン分泌(GHおよびACTH)下垂体腺腫の両方で,信頼できるRT-qPCR遺伝子発現に対する最適参照遺伝子または遺伝子組合せを見出し,検証するため。30の一般的に用いられる参照遺伝子(PCRアレイ参照遺伝子パネル,BioRad,Hercles,CA)を,24の下垂体腺腫(12のNFPA,8GHと4ACTH)でRT-qPCRによって定量化した。データを3つのプログラム,すなわちgeNorm(Qbase+),NormfinderおよびBestKeeperを用いて分析し,最も安定した参照遺伝子または参照遺伝子の組合せを同定した。3つの参照遺伝子ALAS1,PSMC4およびGAPDHを,223腺腫(141NFPA,63GHおよび19ACTH)のより大きなコホートにおける更なる検証のために選択した。すべての腺腫において,ALAS1とPSMC4は,geNormとNormfinderによって推定した最も安定した参照遺伝子であったが,一方,Bestkeeperは10の注意深く選択した遺伝子のうち2つの最も安定したRPLP0とACTBをランク付けした。最良の遺伝子組合せは,PSMC4とALAS1(geNorm)またはPSMC4とGAPDH(Normfinder)であった。検証実験(geNorm)は,最も安定した遺伝子組合せがNFPAにおけるALAS1とGAPDH,およびホルモン分泌腺腫におけるPSMC4とGAPDHであることを示した。参照遺伝子のいくつかは,いくつかの候補遺伝子を生じる良好な安定性を発現した。PSMC4とALAS1は,ランキング順序で単に異なる下垂体腺腫において,全体的に最も安定して発現した遺伝子であった。PSMC4とALAS1は下垂体腺腫の参照遺伝子としてこれまで報告されていない。種々の参照遺伝子アルゴリズムはトップランク遺伝子の混合選択を示し,参照遺伝子の個別化及び合理的選択の必要性を示唆した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  ACTH ,  *遺伝子 ,  グリセルアルデヒドリン酸デヒドロゲナーゼ ,  *腺腫 ,  *母集団 ,  正規化 ,  遺伝子発現 ,  逆転写 ,  *下垂体腺腫 ,  *定量的PCR法 ,  候補遺伝子 ,  ホルモン分泌 ,  *参照遺伝子 ,  分子遺伝現象

著者キーワード (7件)： 非機能性下垂体腺腫(NFPA) ,  PCRアレイ ,  遺伝子発現 ,  geノルム ,  NormFinder ,  ベストキーパー ,  MIQEガイドライン

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (9件)： 下垂体腺腫 ,  大規模 ,  コホート ,  RT ,  qPCR ,  分析 ,  信頼 ,  参照遺伝子 ,  検証