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J-GLOBAL ID：202202253362200470   整理番号：22A1089477

酵素触媒反応における立体配座変化:触媒残基の構造研究【JST・京大機械翻訳】

Conformational Variation in Enzyme Catalysis: A Structural Study on Catalytic Residues

著者 (4件)： Riziotis Ioannis G. (European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, CB10 1SD Cambridge, UK) ,  Ribeiro Antonio J.M. (European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, CB10 1SD Cambridge, UK) ,  Borkakoti Neera (European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, CB10 1SD Cambridge, UK) ,  Thornton Janet M. (European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, CB10 1SD Cambridge, UK)
資料名： Journal of Molecular Biology  (Journal of Molecular Biology)
巻： 434  号： 7  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： D0124B  ISSN： 0022-2836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 触媒残基における立体配座変化は,酵素結晶構造における代替スナップショットとして捉えることができる。活性部位の柔軟性が触媒作用のための酵素の本質的で本質的な性質であるかどうかの疑問を追い,著者らは,機構および触媒部位Atlasからの明示的触媒残基アノテーションおよび蛋白質データバンクからの構造データを使用して,925の酵素ファミリーの活性部位の3D変異に関する包括的研究を提示する。活性部位の機能性原子の重み付きペアワイズ重ね合わせにより,単一残基レベルで構造可変性を捕捉し,リガンドが結合または変異が起こるので,幾何学的変化を調べた。酵素の触媒中心は,それらが機能する機能に従って,本質的に剛直または柔軟であり,構造可変性は,通常,触媒残基のサブセットを含み,通常,結合の形成または開裂に直接関与しないことを示した。さらに,データは,活性部位の2/3が柔軟で,それらの半分において,柔軟性が側鎖でのみ観察されることを示唆する。本研究の目標は,触媒作用の心臓における柔軟性の程度に関する現在の知識を特性化し,最終的に,酵素が新しい機能を進化させ,異なる基質を結合するので,触媒作用の進化の文脈で著者らの知見を究極的に置くことである。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶構造 ,  心臓 ,  *酵素 ,  *配座転移 ,  基質 ,  *酵素反応 ,  活性部位 ,  柔軟性 ,  側鎖 ,  三次元 ,  配位子 ,  アノテーション
準シソーラス用語： 触媒作用 ,  スナップショット ,  *残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 触媒反応 ,  酵素 ,  触媒残さ ,  構造 ,  柔軟性

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： 酵素触媒反応 ,  立体配座変化 ,  触媒 ,  残基 ,  研究