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J-GLOBAL ID：202202255330751880   整理番号：22A1177754

新規植物成長促進根圏細菌としてのRahnella aceris ZF458の比較ゲノミクス支援機能特性化【JST・京大機械翻訳】

Comparative Genomics Assisted Functional Characterization of Rahnella aceris ZF458 as a Novel Plant Growth Promoting Rhizobacterium

著者 (8件)： Xu Shuai (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Zhao Yurong (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Peng Yue (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Shi Yanxia (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Xie Xuewen (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Chai Ali (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Li Baoju (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Li Lei (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 850084  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くのRahnella株は植物の成長を促進し,病原体から植物を保護する可能性を有する植物成長促進根圏細菌として広く記述されている。R.acetris ZF458は,生物防除の可能性を有する湿地土壌から分離した有益な植物細菌である。菌株ZF458は多様な植物病原体に対して広いスペクトル拮抗活性を示し,ヒマワリにおけるAgrobacterium tumefaciensの制御に劇的な効果を示した。R.aceris ZF458ゲノム配列は,平均G+C含量52.20%で,4,861,340-bp環状染色体と2つのプラスミドを含んでいた。系統発生分析は,R.aceris ZF458がR.aceris SAP-19に密接に関連していることを示した。ゲノムアノテーションおよび比較ゲノミクスは,菌株ZF458における植物に特異的である窒素固定,植物成長ホルモン産生,有機酸生合成およびピロロキノリンキノン産生に関連した多数の遺伝子の保存および特異性を同定した。さらに,細菌分泌系,セレン代謝,2成分系,鞭毛生合成,走化性および酸耐性を含む環境適応に関連する多数の保存遺伝子もZF458ゲノムにおいて同定された。全体として,これは,R.acerisにおける植物成長促進および環境適応と関連する遺伝子を系統的に分析する最初の研究であった。本研究の目的は,植物成長促進根圏細菌の機構の詳細な洞察を提供し,農業分野におけるR.aceris ZF458の適用を改善するためにさらに利用できるゲノム情報を得ることであった。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： セレン ,  *細菌 ,  生合成 ,  有機酸 ,  遺伝子 ,  拮抗作用 ,  走化性 ,  ヌクレオチド配列 ,  ヒマワリ ,  ゲノム ,  プラスミド ,  生物的防除 ,  病原体 ,  環境順応 ,  アノテーション
準シソーラス用語： ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Rahnella aceris ZF458 ,  比較ゲノム解析 ,  生物学的制御 ,  植物の成長促進 ,  環境適応

分類 (1件)： 生物的防除  (FC05030B)

引用文献 (93件)：

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• Alvarez-Martinez C. E., Christie P. J. (2009). Biological diversity of prokaryotic type IV Secretion. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 73 775-808. doi: 10.1371/10.1128/MMBR.00023-09
• Amos B., Rolf A. (2000). The SWISS-PROT protein sequence database and its supplement TrEMBL in 2000. Nucleic Acids Res. 28 45-48. doi: 10.1093/nar/28.1.45

タイトルに関連する用語 (5件)： 植物成長促進根圏細菌 ,  Rahnella ,  比較ゲノミクス ,  支援 ,  機能特性