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J-GLOBAL ID：202202255353426840   整理番号：22A0231887

開花に対するイネ日を予測するための作物モデリングによるゲノミクスの統合:マルチモデル解析【JST・京大機械翻訳】

Integration of Genomics with Crop Modeling for Predicting Rice Days to Flowering: A Multi-Model Analysis

著者 (24件)： Yang Yubin (Texas A&M AgriLife Research Center at Beaumont, USA) ,  Wilson Lloyd T. (Texas A&M AgriLife Research Center at Beaumont, USA) ,  Li Tao (DNDC Applications Research and Training, 87 Packers Falls Road, Durham, USA) ,  Paleari Livia (University of Milan, Cassandra lab, ESP, Italy) ,  Confalonieri Roberto (University of Milan, Cassandra lab, ESP, Italy) ,  Zhu Yan (MARA Key Laboratory for Crop System Analysis and Decision Making / Jiangsu Key Laboratory for Information Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, Jiangsu, PR China) ,  Tang Liang (MARA Key Laboratory for Crop System Analysis and Decision Making / Jiangsu Key Laboratory for Information Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, Jiangsu, PR China) ,  Qiu Xiaolei (MARA Key Laboratory for Crop System Analysis and Decision Making / Jiangsu Key Laboratory for Information Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, Jiangsu, PR China) ,  Tao Fulu (Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences, Beijing, PR China) ,  Tao Fulu (Natural Resources Institute Finland (Luke), Helsinki, Finland) ,  Chen Yi (Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences, Beijing, PR China) ,  Hoogenboom Gerrit (University of Florida, Gainesville, USA) ,  Boote Kenneth J. (University of Florida, Gainesville, USA) ,  Gao Yujing (University of Florida, Gainesville, USA) ,  Onogi Akio (Laboratory of Biological Data Science, Department of Plant Life Science, Faculty of Agriculture, Ryukoku University, Shiga, Japan) ,  Nakagawa Hiroshi (Institute for Agro-Environmental Sciences, National Agriculture and Food Research Organization, Tsukuba, Japan) ,  Yoshida Hiroe (Institute for Agro-Environmental Sciences, National Agriculture and Food Research Organization, Tsukuba, Japan) ,  Yabe Shiori (Institute of Crop Science, National Agriculture and Food Research Organization 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Dingkuhn Michael (CIRAD, UMR AGAP, F-34398 Montpellier, France) ,  Dingkuhn Michael (AGAP, University of Montpellier, CIRAD, INRA, INRIA, Montpellier SupAgro, Montpellier, France) ,  Lafarge Tanguy (CIRAD, UMR AGAP, F-34398 Montpellier, France) ,  Lafarge Tanguy (AGAP, University of Montpellier, CIRAD, INRA, INRIA, Montpellier SupAgro, Montpellier, France) ,  Hasegawa Toshihiro (Tohoku Agricultural Research Center, National Agricultural and Food Research Organization, Morioka, Japan) ,  Wang Jing (Texas A&M AgriLife Research Center at Beaumont, USA)
資料名： Field Crops Research  (Field Crops Research)
巻： 276  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1910A  ISSN： 0378-4290  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 複雑な形質を分解して,根底にあるプロセスを統合するための作物モデルの能力は,多様な環境における遺伝子型-環境相互作用を捉えることを可能にする。生物物理学的作物モデルとのゲノムの統合は,生物学的組織にわたる遺伝子型-環境相互作用の理解を改善するための潜在的ブレークスルー技術である。ゲノム予測による作物モデリングの統合に関するマルチモデル解析の結果を示した。7つのイネモデルを,13倍交差検証法を用いて,ゲノムワイド関連とゲノム予測を通して推定されたパラメータから10環境における開花までの日数を予測する能力について評価した。表現型データは,700kマーカーを持つ169系統のイネ多様性パネルに基づいた。いくつかのモデルパラメータについて既知の開花遺伝子との有意な関連を同定した。キャリブレーションにおけるモデルパラメータのゲノム予測のために高い精度が達成されたが,予測精度は未試験遺伝子型に対して低かった。ゲノム予測モデルパラメータを用いて発散モデル性能を観察し,それは光周期と温度応答曲線,および較正モデルパラメータの数に起因した。複雑な形質形成の遺伝的制御をよりよく理解し,作物モデリングとゲノムの統合を改良できるさらなる研究のために,いくつかの領域を同定した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *農作物 ,  生体組織 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  表現型 ,  ゲノム ,  *開花 ,  遺伝的調節 ,  生物物理学 ,  熱応答
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  遺伝子環境相互作用 ,  予測精度 ,  モデルパラメータ ,  作物モデル , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ゲノムワイド関連 ,  ゲノム予測 ,  作物モデル ,  米 ,  開花への日 ,  光周期感度 ,  温度応答

分類 (2件)： 作物の品種改良  (FC02030G) ,  トウモロコシ  (FC03034D)

タイトルに関連する用語 (9件)： 開花 ,  イネ ,  予測 ,  作物 ,  モデリング ,  ゲノミクス ,  統合 ,  マルチ ,  モデル解析