文献

J-GLOBAL ID：202202258444731808   整理番号：22A0577923

DNAメチル化に基づく年齢予測と体液タイピングに関する協調運動【JST・京大機械翻訳】

A collaborative exercise on DNA methylation-based age prediction and body fluid typing

著者 (29件)： Lee Ji Eun (Department of Forensic Medicine, Seoul National University College of Medicine, Seoul, South Korea) ,  Lee Jeong Min (Department of Forensic Medicine, Seoul National University College of Medicine, Seoul, South Korea) ,  Naue Jana (Institute of Forensic Medicine, Medical Center - University of Freiburg, Faculty of Medicine, University of Freiburg, Freiburg, Germany) ,  Fleckhaus Jan (Institute of Legal Medicine, Faculty of Medicine and University Hospital Cologne, University of Cologne, Cologne, Germany) ,  Freire-Aradas Ana (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Sciences, University of Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Galicia, Spain) ,  Neubauer Jacqueline (Zurich Institute of Forensic Medicine, University of Zurich, Zurich, Switzerland) ,  Pospiech Ewelina (Malopolska Centre of Biotechnology, Jagiellonian University, Krakow, Poland) ,  McCord Bruce (Department of Chemistry and Biochemistry, Florida International University, Miami, FL, USA) ,  Kalamara Vivian (Erasmus MC, University Medical Center Rotterdam, Department of Genetic Identification, Rotterdam, The Netherlands) ,  Gauthier Quentin (Department of Chemistry and Biochemistry, Florida International University, Miami, FL, USA) ,  Mills Carly (Department of Forensic Sciences, The George Washington University, Washington, D.C., USA) ,  Cao Yijian (Department of Forensic Sciences, The George Washington University, Washington, D.C., USA) ,  Wang Zheng (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Medical Sciences & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Oh Yu Na (Defense Institute of Forensic Science, Ministry of National Defense, Seoul, South Korea) ,  Feng Lei (Institute of Forensic Science, Ministry of Public Security, Beijing, China) ,  Schneider Peter M. (Institute of Legal Medicine, Faculty of Medicine and University Hospital Cologne, University of Cologne, Cologne, Germany) ,  Phillips Christopher (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Sciences, University of Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Galicia, Spain) ,  Haas Cordula (Zurich Institute of Forensic Medicine, University of Zurich, Zurich, Switzerland) ,  Pisarek Aleksandra (Malopolska Centre of Biotechnology, Jagiellonian University, Krakow, Poland) ,  Branicki Wojciech (Laboratory of Anthropology, Institute of Zoology and Biomedical Research, Jagiellonian University, Krakow, Poland) ,  Podini Daniele (Department of Forensic Sciences, The George Washington University, Washington, D.C., USA) ,  Vidaki Athina (Erasmus MC, University Medical Center Rotterdam, Department of Genetic Identification, Rotterdam, The Netherlands) ,  Tejero Nicole Fernandez (Department of Chemistry and Biochemistry, Florida International University, Miami, FL, USA) ,  Ambroa-Conde Adrian (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Sciences, University of Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Galicia, Spain) ,  Mosquera-Miguel Ana (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Sciences, University of Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Galicia, Spain) ,  Lareu Maria Victoria (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Sciences, University of Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Galicia, Spain) ,  Hou Yiping (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Medical Sciences & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Lee Joo Young (Defense Institute of Forensic Science, Ministry of National Defense, Seoul, South Korea) ,  Lee Hwan Young (Department of Forensic Medicine, Seoul National University College of Medicine, Seoul, South Korea)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 57  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAメチル化は,法医学分野における年齢予測と体液同定のための最も有用なバイオマーカーの1つになった。したがって,年齢関連および体液特異的DNAメチル化変化を検出するいくつかのアッセイが開発されている。開発された多くの方法の中で,SNaPshotベースの分析は,多重分析を可能にし,STR分析として同じキャピラリー電気泳動装置を使用するので,法医学研究所で特に有用である。しかし,任意の開発アッセイの技術的検証は,日常法医学ワークフローへのそれらの適切な統合のために重要である。本協調運動では,年齢予測のための2つのSNaPshotマルチプレックスアッセイと体液同定のためのSNaPshotマルチプレックスを12の研究室で試験した。運動の実験的セットアップは,SNaPshotベースのメチル化分析の全ワークフローを反映するように設計され,メチル化測定に影響する潜在的因子を検出するために設計された4つのますます複雑な作業を含んだ。各研究室からの体液同定の結果は,その後の分析において適切な年齢予測法を決定する十分な情報を提供した。年齢予測において,用いた遺伝子分析器のタイプから生じる系統的測定差異を,実験室間のDNAメチル化変動の最大原因として同定した。また,非特異的プライマー結合に対する比の高い比を確実にする緩衝液の使用は,特にPCR反応における変性プライマーを用いるとき,DNAメチル化測定の変化をもたらした。さらに,亜硫酸水素変換DNAの高い投入量は,おそらく,亜硫酸水素変換反応からのPCR阻害剤のキャリーオーバーにより,PCR失敗を引き起こした。効率的なSNaPshot反応のための分析者と実験条件の熟達度は,一貫したDNAメチル化測定にも重要であった。いくつかの亜硫酸水素変換キットを本研究に用いたが,どんな特異的キットの使用から生じる差異も明確に識別されなかった。異なる実験設定が各実験室で使用された場合でも,本研究の陽性結果は,精液の2.7年,血液の5.0年および唾液の3.8年の参加者のデータの間の平均絶対年齢予測誤差であった。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水素 ,  血液 ,  *メチル化 ,  *DNA【核酸】 ,  精液 ,  変性 ,  キャリオーバ ,  亜硫酸 ,  多重化 ,  法医学 ,  プライマー【遺伝】 ,  PCR法 ,  バイオマーカー ,  キャピラリー電気泳動
準シソーラス用語： *DNAメチル化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： DNAメチル化 ,  SNaPhot ,  体液同定 ,  年齢予測

分類 (2件)： 法医学  (GA03000B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： DNAメチル化 ,  年齢 ,  予測 ,  体液 ,  タイピング ,  協調運動