文献

J-GLOBAL ID：202202259031473903   整理番号：22A0464065

血友病Aのない患者における全ゲノムシークエンシングを用いたF8を含む2つの新しい大きなXq28重複の完全な特性化【JST・京大機械翻訳】

Complete characterisation of two new large Xq28 duplications involving F8 using whole genome sequencing in patients without haemophilia A

著者 (19件)： Jourdy Yohann (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service d’hematologie Biologique, Bron, France) ,  Jourdy Yohann (UR 4609 Hemostase et thrombose, Universite Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France) ,  Bardel Claire (Hospices Civils de Lyon, Groupement Hospitalier Est, Cellule bioinformatique de la plateforme de sequencage NGS, Lyon, France) ,  Bardel Claire (Universite de Lyon, Universite Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biometrie et Biologie Evolutive UMR 5558, Villeurbanne, France) ,  Bardel Claire (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service de genetique, Bron, France) ,  Fretigny Mathilde (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service d’hematologie Biologique, Bron, France) ,  Diguet Flavie (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service de genetique, Bron, France) ,  Rollat-Farnier Pierre-Antoine (Hospices Civils de Lyon, Groupement Hospitalier Est, Cellule bioinformatique de la plateforme de sequencage NGS, Lyon, France) ,  Rollat-Farnier Pierre-Antoine (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service de genetique, Bron, France) ,  Mathieu Marie-Laure (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est Service de Neuropediatrie, Bron, France) ,  Labalme Audrey (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service de genetique, Bron, France) ,  Sanlaville Damien (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service de genetique, Bron, France) ,  Sanlaville Damien (Institut Neuromyogene, Equipe Metabolisme energetique et developpement neuronal, CNRS UMR 5310, INSERM U1217, Universite Lyon 1, Lyon, France) ,  Edery Patrick (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service de genetique, Bron, France) ,  Edery Patrick (CRNL, equipe GENDEV INSERM U1028, CNRS UMR5292, Universite Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France) ,  Vinciguerra Christine (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service d’hematologie Biologique, Bron, France) ,  Vinciguerra Christine (UR 4609 Hemostase et thrombose, Universite Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France) ,  Schluth-Bolard Caroline (Hospices Civils de Lyon, Groupe Hospitalier Est, Service de genetique, Bron, France) ,  Schluth-Bolard Caroline (Institut Neuromyogene, Equipe Metabolisme energetique et developpement neuronal, CNRS UMR 5310, INSERM U1217, Universite Lyon 1, Lyon, France)
資料名： Haemophilia  (Haemophilia)
巻： 28  号： 1  ページ： 117-124  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1809A  ISSN： 1351-8216  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 序論:得られた領域の挿入の位置に依存して,F8重複は,重度の血友病A表現型に対する良性影響から,多様な臨床的影響を有する。【目的】重度の知的障害を呈する2人の患者における染色体マイクロアレイ分析(CMA)によって偶然に検出されるF8を含む2つの大きなXq28重複を特徴づけること,しかし,出血障害の病歴はない。方法:全ゲノム配列決定(WGS)を行い,ヌクレオチドレベルで2つの大きなXq28重複を特性化した。【結果】患者1において,F8とSMIM9のエキソン23-26を含む60-73kbの領域は,int22h-1とint22h-2の間の非相同組換えの後,int22h-2遺伝子座に挿入された。著者らは,2つの独立した事象,ミクロホモロジー媒介破壊誘導複製(MMBIR)と切断誘導複製(BIR)が,この再配列に関与すると仮定した。患者2では,CMAはF8とSMIM9のエキソン16-26を網羅する101から116kbまでの重複を見出した。WGS分析は,3つのゲノム結合の存在によるより複雑な再配列を同定した。ブレークポイントで観察された複数のミクロホモロジーにより,フォーク失速やテンプレートスイッチング(FoSTeS)のような複製ベースのメカニズムが大いに疑われた。両事例において,これらの複合再配列はF8の無傷コピーを保持した。結論:本研究は,ヌクレオチドレベルでゲノム接合を特徴づけるWGSの価値を強調し,最終的にXq28構造変化に関与する分子機構を記述する。また,遺伝子型-表現型相関と遺伝的コウンセリングを改善するために,ゲノム獲得の構造の特定の重要性を強調した。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 失速 ,  遺伝 ,  染色体 ,  ヌクレオチド ,  表現型 ,  *ゲノム ,  ホモロジー ,  *血友病 ,  知能障害 ,  DNAマイクロアレイ
準シソーラス用語： 非相同組換 ,  分子機構 ,  ゲノム配列 ,  構造変化 ,  再配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 重複 ,  F8 ,  遺伝子再編成 ,  血友病 ,  全ゲノム配列決定

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： 血友病A ,  患者 ,  ゲノム ,  シークエンシング ,  特性化