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J-GLOBAL ID:202202264717137507   整理番号:22A0884786

タンパク質立体構造予測システムAlphaFoldのTSUBAME3.0上での高速化

著者 (5件):
資料名:
巻: 2022  号: HPC-183  ページ: Vol.2022-HPC-183,No.3,1-7 (WEB ONLY)  発行年: 2022年03月10日 
JST資料番号: U0451A  資料種別: 会議録 (C)
記事区分: 原著論文  発行国: 日本 (JPN)  言語: 日本語 (JA)
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タンパク質の立体構造の理解はタンパク質の機能の理解に役立ち,...
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分類 (2件):
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分子構造  ,  数値計算 
引用文献 (21件):
  • wwPDB Consortium. Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data. Nucleic Acids Res. 47, D520-D528 (2018).
  • Mitchell, A. L. et al. MGnify: the microbiome analysis resource in 2020. Nucleic Acids Res. 48, D570-D578 (2020).
  • Steinegger, M., Mirdita, M. & Söding, J. Protein-level assembly increases protein sequence recovery from metagenomic samples manyfold. Nat. Methods 16, 603-606 (2019).
  • Moult, J., Fidelis, K., Kryshtafovych, A., Schwede, T. & Topf, M. Critical assessment of techniques for protein structure prediction, fourteenth round. CASP 14 Abstract Book https://www.predictioncenter.org/casp14/doc/CASP14_Abstracts.pdf (2020).
  • Jumper, J., Evans, R., Pritzel, A. et al. Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold. Nature 596, 583-589 (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03819-2
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