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J-GLOBAL ID：202202277836174872   整理番号：22A0454265

Agrobacterium tumefaciens仲介遺伝子導入により得られた編集植物の分子特性化のための統合アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Integrated approach for the molecular characterization of edited plants obtained via Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer

著者 (9件)： Dalla Costa Lorenza (Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige, Italy) ,  Vinciguerra Daniela (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Lazio e della Toscana “M. Aleandri” Centro di Referenza Nazionale per la Ricerca di Organismi Geneticamente Modificati (CROGM), Rome, Italy) ,  Giacomelli Lisa (Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige, Italy) ,  Salvagnin Umberto (Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige, Italy) ,  Piazza Stefano (Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige, Italy) ,  Spinella Katia (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Lazio e della Toscana “M. Aleandri” Centro di Referenza Nazionale per la Ricerca di Organismi Geneticamente Modificati (CROGM), Rome, Italy) ,  Malnoy Mickael (Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige, Italy) ,  Moser Claudio (Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige, Italy) ,  Marchesi Ugo (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Lazio e della Toscana “M. Aleandri” Centro di Referenza Nazionale per la Ricerca di Organismi Geneticamente Modificati (CROGM), Rome, Italy)
資料名： European Food Research & Technology  (European Food Research & Technology)
巻： 248  号： 1  ページ： 289-299  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0437A  ISSN： 1438-2377  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Agrobacterium tumefaciens媒介遺伝子導入は,植物ゲノムにおけるT-DNAの多重コピーの統合,ならびに修飾細胞と野生型細胞からなるキメラ組織への,植物-マリーの多コピーの統合をもたらす。したがって,変換されたラインの分子特性化は,さらなる研究のために最良のものを選択するための良好な実践である。今日,いくつかの定量的および半定量的技術が,遺伝的に改変された植物におけるT-DNAのコピー数(CN)を推定するために利用可能である。本研究では,(1)リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(qPCR),(2)液滴デジタルPCR(ddPCR),および(3)次世代シークエンシング(NGS)に基づく3つの方法を比較し,ブドウの編集された系統の分子特性化を行った。これらの系統はCRISPR/Cas9技術により得られたノックアウト突然変異を含み,ブドウの2つの重要なうどんこ病に対する植物感受性に関与する遺伝子である。著者らの結果によると,qPCRとddPCR出力は,特に低いCN値に関して,精度に関してかなり一致し,一方,ddPCRはqPCRより正確であった。NGS分析に関して,この方法で検出したCNsはqPCRおよびddPCRによって計算されたCNsとしばしば一致せず,NGSは10系統のうち3つで統合点を識別できなかった。それにもかかわらず,NGS法は,T-DNA切断またはタンデム/反転反復の存在を明確に同定することができ,導入遺伝子統合セットに関する明確で適切な情報を提供する。さらに,Cas9および単一ガイドRNA(sgRNA)の発現分析および標的部位の配列決定は,CNデータに関連する新しい情報を付加した。本研究は,ブドウの編集された系統に関する実用的な事例研究を報告することによって,適切なトランスジェニック材料の早熟な選択のために利用可能な最も進んだ診断技術のprosと短所を調査する。結果は,新しいトランスジェニック系統を開発する科学者,およびGMO制御の充電における研究室にとって興味深い。Copyright The Author(s) 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ブドウ ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  突然変異 ,  キメラ ,  事例研究 ,  T-DNA ,  *Agrobacterium tumefaciens ,  *遺伝子導入 ,  コピー数 ,  リアルタイムPCR法 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 導入遺伝子 ,  次世代シークエンシング ,  Cas9 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： GMO ,  ゲノム編集 ,  コピー数定量化 ,  qPCR ,  ddPCR ,  NGS

分類 (3件)： 食品の分析  (FJ01030U) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (7件)： Agrobacterium ,  仲介 ,  遺伝子導入 ,  編集 ,  植物 ,  分子特性 ,  統合