文献

J-GLOBAL ID：202202280044517460   整理番号：22A0725908

食品蛋白質と生物活性ペプチドを研究するための分子ドッキング解析と分子動力学シミュレーションの統合【JST・京大機械翻訳】

Integration of Molecular Docking Analysis and Molecular Dynamics Simulations for Studying Food Proteins and Bioactive Peptides

著者 (3件)： Vidal-Limon Abraham (Red de Estudios Moleculares Avanzados, Cluster Cientifico y Tecnologico BioMimic, Instituto de Ecologia A.C. (INECOL), Veracruz, Mexico) ,  Aguilar-Toala Jose E. (Departamento de Ciencias de la Alimentacion, Division de Ciencias Biologicas y de la Salud, Universidad Autonoma Metropolitana Unidad Lerma, Estado de Mexico, Mexico) ,  Liceaga Andrea M. (Protein Chemistry and Bioactive Peptides Laboratory. Department of Food Science, Purdue University, Indiana, United States)
資料名： Journal of Agricultural and Food Chemistry  (Journal of Agricultural and Food Chemistry)
巻： 70  号： 4  ページ： 934-943  発行年： 2022年 
JST資料番号： C0251A  ISSN： 0021-8561  CODEN： JAFCAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分子ドッキングのようなin silicoツールは,蛋白質およびペプチドの生物活性の相互作用および結合親和性の研究に広く適用されている。しかしながら,リガンドと受容体立体配座の限られたサンプリングと近似スコアリング関数の使用は,実際の実験的結合親和性と相関しない結果を生じる。分子動力学シミュレーション(MDS)は,蛋白質/ペプチドおよび他の生体分子の機能的機構の解明に貴重な情報を提供することができ,ドッキング分析における剛直なサンプリング限界を克服する。本レビューでは,分子ドッキングのようなin silicoモデルの伝統的使用に関連する情報,および食品蛋白質および生物活性ペプチドを研究するためのその応用,およびその後のMDSの理論への詳細な導入,およびこれらの分子シミュレーション技術が食品蛋白質および生物活性ペプチドの構造的および機能的動力学の理論的予測において重要である理由の記述について論じる。MDSの応用,限界,および将来展望についても議論する。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子間相互作用 ,  立体配座 ,  *計算機シミュレーション ,  *ドッキング ,  *ペプチド ,  受容体 ,  *タンパク質 ,  近似法 ,  *生物活性 ,  親和性 ,  *分子認識 ,  *生理活性ペプチド
準シソーラス用語： 結合親和性 ,  分子シミュレーション ,  in silico ,  *分子動力学シミュレーション ,  生体分子 ,  *分子ドッキング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 分子ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  蛋白質とペプチド ,  分子相互作用

分類 (4件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  食品の化学・栄養価  (FJ01020J) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  食品蛋白質  (FJ09020N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 食品蛋白質 ,  生物活性ペプチド ,  研究 ,  分子ドッキング ,  解析 ,  分子動力学シミュレーション ,  統合