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J-GLOBAL ID：202202284900516934   整理番号：22A0729869

免疫細胞環境における10xゲノミクス単一細胞RNA配列決定法の再現性【JST・京大機械翻訳】

Reproducibility of 10x Genomics single cell RNA sequencing method in the immune cell environment

著者 (8件)： Kraus Gloria (Faculty of Medicine, DFG Center for Regenerative Therapies Dresden, Technische Universitaet Dresden, Dresden, Germany,) ,  Weigelt Marc (Faculty of Medicine, DFG Center for Regenerative Therapies Dresden, Technische Universitaet Dresden, Dresden, Germany,) ,  Reinhardt Susanne (DRESDEN-Concept Genome Center c/o Center for Molecular and Cellular Bioengineering, Technische Universitaet Dresden, Dresden, Germany,) ,  Petzold Andreas (DRESDEN-Concept Genome Center c/o Center for Molecular and Cellular Bioengineering, Technische Universitaet Dresden, Dresden, Germany,) ,  Dahl Andreas (DRESDEN-Concept Genome Center c/o Center for Molecular and Cellular Bioengineering, Technische Universitaet Dresden, Dresden, Germany,) ,  Bonifacio Ezio (Faculty of Medicine, DFG Center for Regenerative Therapies Dresden, Technische Universitaet Dresden, Dresden, Germany,) ,  Bonifacio Ezio (German Center for Diabetes Research (DZD), Paul Langerhans Institute Dresden, Technische Universitaet Dresden, Dresden, Germany,) ,  Bonifacio Ezio (Institute of Diabetes and Obesity, Helmholtz Zentrum Muenchen, German Research Center for Environmental Health, Neuherberg, Germany)
資料名： Journal of Immunological Methods  (Journal of Immunological Methods)
巻： 502  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0816B  ISSN： 0022-1759  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 10xゲノムは,適応免疫系の細胞における受容体鎖の組み合わせの同時遺伝子発現解析と同定を可能にする高度にアクセス可能な単一細胞RNA配列決定プラットフォームである。ここでは,末梢血単核細胞(PBMC)における遺伝子と受容体発現測定が,技術的,細胞凍結,FACS処理,および日生物学的変動に影響を受けるかどうかを尋ねた。凍結PBMCの同じバイアルから採取された1.3分の1の間で,差次的発現遺伝子は観察されなかった。2.凍結PBMCの3回バイアル;および3.異なる日に同じドナーから分離および凍結したPBMCの間で,少数の差次的発現遺伝子が観察され,これらの差異は他の細胞集団よりも記憶B細胞においてより顕著であった。T細胞受容体は,クロノタイプ当たり少なくとも5細胞が同定されたとき,すべての複製で回復した。これらの知見は,免疫細胞状況における10xゲノム単一細胞RNA配列決定データの高い再現性を示した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ドナー ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *細胞 ,  凍結 ,  バイアル瓶 ,  リンパ球 ,  ゲノム ,  単球 ,  T細胞受容体
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  末梢血単核球 ,  *免疫細胞 ,  *単一細胞 ,  適応免疫 ,  末梢血単核細胞 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 単一細胞 ,  遺伝子発現解析 ,  T細胞受容体(TCR) ,  10xゲノミクス ,  再現性 ,  末梢血単核細胞(PBMC)

分類 (2件)： 抗原・抗体・補体の生産と応用  (ED04030W) ,  生体防御と免疫系研究法  (ED01020Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 免疫細胞 ,  環境 ,  ゲノミクス ,  単一細胞 ,  RNA ,  再現性