クロトナーゼスーパーファミリーにおける構造ゲノミクス蛋白質の機能特性化【JST・京大機械翻訳】

Mills Caitlyn L.; Yin Pengcheng; Leifer Becky; Ferrins Lori; O’Doherty George A.; Beuning Penny J.; Ondrechen Mary Jo; Ondrechen Mary Jo

文献

J-GLOBAL ID：202202290355380357 整理番号：22A0727081

クロトナーゼスーパーファミリーにおける構造ゲノミクス蛋白質の機能特性化【JST・京大機械翻訳】

Functional Characterization of Structural Genomics Proteins in the Crotonase Superfamily

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資料名：
巻： 17 号： 2 ページ： 395-403 発行年： 2022年
JST資料番号： W5037A ISSN： 1554-8937 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

保存された四次構造を共有する蛋白質の機構的に多様なファミリーであるCrotonaseスーパーファミリーのメンバーは,しばしば1つ以上の反応を触媒することができる。しかし,そのメンバーに対する活性スペクトルはよく研究されていない。著者らは,ヒトエノイルCoAヒドラターゼ(ECH)およびβ-ジケトンヒドロラーゼのコントロールとして意図されたCrotonaseスーパーファミリープラス2つの以前に特性化された蛋白質由来の8つの構造ゲノミクス(SG)蛋白質に対するクロトナーゼおよびヒドロラーゼ活性を測定した。蛋白質データバンク(PDB)に沈着した15000+SG蛋白質構造の大部分と同様に,8つのSG蛋白質は未知または不確かな生化学的機能である。8つのSG蛋白質の機能的特性化は,機能的アノテーションに対する局所構造に基づく計算アプローチである,構造配列活性部位活性(SALSA)により誘導される。ヒトECHでは,ヒドロラーゼ活性に対するターンオーバー数はECH活性より3倍高かったが,触媒効率はECHで160倍高かった。ECHとして最初に注釈付けされた3つのSG蛋白質は,加水分解酵素であるSALSAによって予測され,以前に特性化されたヒドロラーゼと同程度に,ECH活性よりもヒドロラーゼ活性に対してより高い触媒効率を有することが観察された。SALSAによって予測された5つのSG蛋白質の中で,ECHsであると予測したが,1つはいくつかのヒドロラーゼ活性を示した。5つの全ては,クロトン-CoA基質に関してヒトECHより低いECH活性を示した。ここでは,SALSAが無差活性を示す酵素ファミリー内でも機能的誤注釈を補正できることを示す例を示した。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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酵素一般

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