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J-GLOBAL ID：202302244239610401   整理番号：23A1465002

臨床検査室におけるナノポアシーケンシング技術を用いた新型コロナウイルス感染症の疫学的解析実用化に向けての取り組み

Genomic analysis of SARS-CoV-2 using nanopore sequencing technology at hospital clinical laboratories

著者 (7件)： 飯尾耕治 (岡山大学病院医療技術部検査部門) ,  後藤和義 (岡山大学学術研究院医歯薬学域病原細菌学分野) ,  萩谷英大 (岡山大学学術研究院医歯薬学域総合内科学分野) ,  小川寛人 (岡山大学学術研究院医歯薬学域病原ウイルス学分野) ,  三好諒 (岡山大学学術研究院医歯薬学域病原細菌学分野) ,  大塚文男 (岡山大学学術研究院医歯薬学域総合内科学分野) ,  東影明人 (岡山大学病院医療技術部検査部門)
資料名： 医学検査  (Japanese Journal of Medical Technology)
巻： 72  号： 2  ページ： 248-255(J-STAGE)  発行年： 2023年 
JST資料番号： S0681B  ISSN： 0915-8669  CODEN： IGKEES  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の世界的パンデミ...

シソーラス用語： *遺伝学実験技術 ,...
準シソーラス用語： 系統樹解析

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著者キーワード (10件)： COVID-19 ,  全ゲノム解析 ,  NGS ,  MinION ,  新興感染症 ,  COVID-19 ,  whole-genome analysis ,  NGS ,  MinION ,  emerging infectious diseases

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症の診断  (GD01020S)

引用文献 (19件)：

• 1) Karim SSA, Karim QA: Omicron SARS-CoV-2 variant: A new chapter in the COVID-19 pandemic. The Lancet, 2021; 398: 2126-2128.
• 2) Cahyani I et al.: Genome profiling of SARS-CoV-2 in Indonesia, ASEAN, and the neighbouring East Asian countries: Features, challenges, and achievements. Viruses, 2022; 14: 778.
• 3) Pater AA et al.: High throughput nanopore sequencing of SARS-CoV-2 viral genomes from patient samples. J Biol Methods, 2021; 8(COVID 19 Spec Iss): e155.
• 4) Brinkmann A et al.: Rapid whole-genome sequencing using multiplex PCR amplification and real-time Oxford Nanopore MinION sequencing enables rapid variant identification of SARS-CoV-2. Front Microbiol, 2021; 12: 651151.
• 5) Pembaur A et al.: Simplified point-of-care full SARS-CoV-2 genome sequencing using nanopore technology. Microorganisms, 2021; 16: 2598.

タイトルに関連する用語 (6件)： 臨床検査室 ,  ナノポアシーケンシング ,  新型コロナウイルス感染症 ,  疫学 ,  解析 ,  実用化