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J-GLOBAL ID:200901009260812721   Update date: Nov. 15, 2024

Nakagawa Atsushi

ナカガワ アツシ | Nakagawa Atsushi
Affiliation and department:
Job title: Professor
Homepage URL  (1): http://www.protein.osaka-u.ac.jp/rcsfp/supracryst/
Research field  (2): Structural biochemistry ,  Biophysics
Research keywords  (2): 構造生物学 ,  Biophysics
Research theme for competitive and other funds  (37):
  • 2022 - 2026 緑膿菌の多剤耐性化機構の解明に向けた薬剤排出タンパク質複合体の構造基盤
  • 2021 - 2024 電気信号を化学信号に変える電位依存性ホスファターゼVSPの動作機構の解明
  • 2019 - 2022 Structure basis for multidrug resistance efflux pump spanning both membranes in Pseudomonas aeruginosa
  • 2015 - 2020 Molecular mechanisms of lipoquality recognition and identification of functional membrane nanodomain
  • 2015 - 2018 A Simulation Study on the Mechanism of Membrane Voltage Depended Protein VSOP
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Papers (377):
  • Yukina Mori, Eiki Yamashita, Atsushi Nakagawa, Tomoki Matsuzawa, Minoru Inagaki, Yoshifumi Aiba, Syu Tanaka, Syunya Hatori, Maeda Ayami, Shigeki Takeda. Determination of the three-dimensional structure of bacteriophage Mu(-) tail fiber and its characterization. Virology. 2024. 593. 110017-110017
  • Tomoki Kita, Kyoko Chiba, Jiye Wang, Atsushi Nakagawa, Shinsuke Niwa. Comparative analysis of two Caenorhabditis elegans kinesins KLP-6 and UNC-104 reveals a common and distinct activation mechanism in kinesin-3. eLife. 2024
  • Kakeru Tagata, Daisuke Kanda, Naoto Kobayashi, Akifumi Higashiura, Satoshi Ichikawa, Noriaki Kishida, Ryoichi Nakatani, Atsushi Nakagawa, Yu Shiratsuchi. Magnetic interaction in superparamagnetic Co-Pt nanoparticles synthesized in protein crystal. IEEE Transactions on Magnetics. 2023. 1-1
  • Ian Costa Paixao, Natsuki Mizutani, Makoto Matsuda, Rizki Tsari Andriani, Takafumi Kawai, Atsushi Nakagawa, Yoshifumi Okochi, Yasushi Okamura. Role of K364 next to the active site cysteine in voltage-dependent phosphatase activity of Ci-VSP. Biophysical journal. 2023. 122. 11. 2267-2284
  • Phimonphan Chuankhayan, Ruey-Hua Lee, Hong-Hsiang Guan, Chein-Chih Lin, Nai-Chi Chen, Yen-Chieh Huang, Masato Yoshimura, Atsushi Nakagawa, Chun-Jung Chen. Structural insight into the hydrolase and synthase activities of an alkaline α-galactosidase from Arabidopsis from complexes with substrate/product. Acta Crystallographica Section D Structural Biology. 2023. 79. 2. 154-167
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MISC (203):
  • 堤研太, 比嘉悠貴, 中川敦史, 山下栄樹. ヘテロ三量体型多剤排出トランスポーターMuxBCの構造解析. 日本結晶学会年会講演要旨集. 2023. 2023
  • 上田雄士, 米原涼, 池田悦子, 中川敦史, 山下栄樹. 多剤排出トランスポーターMexBの中性付近の結晶構造解析. 日本結晶学会年会講演要旨集. 2023. 2023
  • 松田真, 山下栄樹, 梶原健太郎, 赤松香奈子, 杉本楓, 岡田雅人, 中川敦史. がん進展に関わるCDCP1の結晶構造解析. 日本結晶学会年会講演要旨集. 2023. 2023
  • 森有希奈, 山下栄樹, 中川敦史, 武田茂樹. Three-dimensional structure of bacteriophage Mu tail fiber and structural comparison with the other tail fiber of Mu phage. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
  • 上田雄士, 荒谷剛史, 米原涼, 池田悦子, 堤研太, 中川敦史, 山下栄樹. 緑膿菌由来膜融合タンパク質MexXの機能解明に向けた構造解析. 日本結晶学会年会講演要旨集. 2022. 2022
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Patents (2):
  • 膜タンパク質構造解析用タンパク質構造体、およびその利用
  • 球状粒子を形成する新規タンパク質、およびそのタンパク質をコードする新規遺伝子
Books (26):
  • AlphaFoldのインパクト
    化学同人 2024
  • Informatics and AI in Chemistry
    Kagaku-Dojin Publishing Company, INC. 2024 ISBN:9784759814101
  • どうして心臓は動き続けるの?生命をささえるタンパク質のなぞにせまる「タンパク質ってどんなかたちをしているの?」
    化学同人 2018 ISBN:9784759819816
  • DNA Methyltransferases - Role and Function
    World Scientific Publishing 2016 ISBN:9783319436241
  • DNA Methyltransferases - Role and Function, Volume 945 of the series Advances in Experimental Medicine and Biology
    Springer International Publishing 2016
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Lectures and oral presentations  (13):
  • Structural studies of voltage sensing phosphatase
    (27th KPPS Anuual Symposium 2024 2024)
  • Structural studies of voltage-sensing phosphatase
    (26th Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography 2023)
  • Structure biology using synchrotron radiation and cryo-electron microscopy
    (2023 Joint Conference - Korean Society for Protein Science & The Korean Biophysical Society 2023)
  • OneDep: Unified System for Deposition, Biocuration, and Validation of Macromolecular Structures and Ligand Library based on CSD data
    (The 27th Biophysics Conference 2023)
  • Structural studies of voltage-sensing phosphatase
    (2023 SPring International Convension of the Pharmaceutical Society of Korea 2023)
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Works (23):
  • 膜近傍で働くタンパク質・酵素群の動的および静的構造解析
    2010 -
  • ターゲットタンパク研究プログラム「高難度タンパク質をターゲットとした放射光X線結晶構造解析技術の開発」
    2010 -
  • ターゲットタンパク研究プログラム「自然免疫システムにおける病原体認識に関わる分子群の構造解析
    2010 -
  • ターゲットタンパク研究プログラム「新規膜電位センサー蛋白群の構造と機能の解明」
    2010 -
  • ターゲットタンパク研究プログラム「新規膜電位センサー蛋白群の構造と機能の解明」
    2009 -
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Education (2):
  • 1983 - 1986 Osaka University Graduate School of Science
  • 1979 - 1983 Nagoya Univeristy Faculty of Science Department of Chemistry
Professional career (1):
  • Doctor of Science (Osaka University)
Work history (9):
  • 2024/03 - 現在 大阪大学, 蛋白質研究所・附属蛋白質解析先端研究センター, センター長
  • 2003/03 - 現在 Osaka University Institute for Protein Research Professor
  • 2022/04 - 2024/03 Osaka University Institute for Protein Research Vice Director
  • 2018/04 - 2022/03 Osaka University Institute for Protein Research Directory
  • 2016/04 - 2018/03 Osaka University Institute for Protein Research, Research Center for State-of-the-Art Functional Protein Analysis Director
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Committee career (53):
  • 2023/10 - 現在 日本学術会議 第26期 IUCr分科会委員長
  • 2023/10 - 現在 Science Council of Japan Associate Members
  • 2023/08 - 現在 The International Union of Crystallography Executive Committee
  • 2022/09 - 現在 The International Union of Crystallography Member of the Meeting Support Committee
  • 2022/06 - 現在 一般財団法人蛋白質研究奨励会 監事
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Awards (2):
  • 2009 - 日本結晶学会 日本結晶学会賞学術賞 放射光を利用した生体超分子構造解析法の開発とその応用
  • 1993 - 日本結晶学会 日本結晶学会進歩賞 放射光利用によるタンパク質の結晶構造解析 -多波長異常分散法の利用-
Association Membership(s) (10):
The Physiological Society of Japan ,  British Crystallographic Association ,  日本蛋白質科学会 ,  日本化学会 ,  日本生化学会 ,  日本生物物理学会 ,  日本放射光学会 ,  日本結晶学会 ,  The Protein Society ,  American Crystallographic Association
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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