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J-GLOBAL ID：200902273543930707   Reference number：07A0080155

Stochastic Prediction of Peptide Secondary Structure Based on Molecular Dynamics Simulation Performed for Nano-second-Effectiveness of the %stickiness Approach Represented by Triangle Map Mode.

ナノ秒のMDシミュレーションから求めたペプチド二次構造の確率予測-三角マップ表示した%スティッキネス法の有用性

Author (5)： MURAYAMA SHIN'ICHI (埼玉大学 工学部 機能材料工学科) ,  YOSHIDA CHUYA (埼玉大学 工学部 機能材料工学科) ,  AOYAMA TAKASHI (埼玉大学 工学部 機能材料工学科) ,  URATA SATOSHI (埼玉大学 工学部 機能材料工学科) ,  NISHIGAKI KOICHI (埼玉大学 工学部 機能材料工学科)
Material： Journal of Computer Chemistry, Japan  (J Comput Chem Jpn)
Volume： 5  Issue： 4  Page： 213-218 (J-STAGE)  Publication year： 2006 
JST Material Number： L1437B  ISSN： 1347-1767  CODEN： JCCJAG  Document type： Article
Article type： 原著論文  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： *molecular dynamics ,...
Semi thesaurus term： mapping ,...

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JST classification (2)： Molecular structure  (EB03020Y) ,  Peptides  (CF10080G)

Reference (10)：

• [1] Gnanakaran S., Nymeyer H., Portman J., Sanbonmatsu K. Y., and Garcia A. E., Curr. Opin. Struc. Biol., 13, 168-174 (2003).
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• [3] Fetrow J. S., Giammona A., Kolinski A., Skolnick J., Curr. Pharm. Biotechnol., 3, 329-47 (2002).
• [4] Baldwin R. L. and Rose G. D., Trends Biochem. Sci., 24, 26-33 (1999).
• [5] Spörlen S., Carstens H., Statzger H., Renner C., Behrendt R., Moroder L., Tavan P., Zinth W., and Wachtveit J., Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 99, 7998-8002 (2002).

Terms in the title (7)： ナノ秒 ,  MDシミュレーション ,  ペプチド ,  確率予測 ,  三角 ,  マップ表示 ,  有用性