植物の遺伝子に生じた特徴的な塩基配列、及びそれを利用する方法

Inventor： , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：原謙三
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2002327515
Publication number (International publication number)：2004113234
Application date： Sep. 27, 2002
Publication date： Apr. 15, 2004
Summary：

【課題】オオムギの遺伝子に生じた一塩基多型(SNP)、及びその利用方法を提供する。【解決手段】オオムギ品種である「H.spontaneum」、「はるな二条」、「赤神力」由来のcDNAクローンを大量シーケンシングし、品種間で一塩基多型(SNP)が認められる部位のうち特に非同義置換を生ぜしめるSNPを見出した。この非同義置換SNPは、品種固有の表現型に関与する可能性が高いことから様々な用途に利用できる。例えば、上記非同義置換SNPを含む領域から合成したオリゴヌクレオチドは、オオムギの遺伝子上にある多型部位の塩基を判定する道具として利用でき、これにより遺伝学的品種識別やいずれのタイプの遺伝子を有するかの判定などが可能となる。また、このオリゴヌクレオチドを遺伝子単離用または一塩基多型検出用のプローブとして用い、新規な形質転換体を生産・選別することもできる。【選択図】なし

Claim (excerpt)：

配列番号1〜534の何れかに表されるDNA配列において、塩基の表記が「ユニバーサルコード」で記載されている多型部位のうち、非同義置換を生ぜしめる多型部位の少なくとも一つを含む7ヌクレオチド以上の連続したDNA配列、またはその相補配列からなるオリゴヌクレオチド。

IPC (9)：

C12N15/09 , A01H5/00 , C12N1/15 , C12N1/19 , C12N1/21 , C12N5/10 , C12Q1/68 , G01N33/53 , G01N33/566

FI (9)：

C12N15/00 A , A01H5/00 Z , C12N1/15 , C12N1/19 , C12N1/21 , C12Q1/68 A , G01N33/53 M , G01N33/566 , C12N5/00 A

F-Term (20)：

2B030AA02 , 2B030AB03 , 2B030AD20 , 2B030CA07 , 4B024AA08 , 4B024AA11 , 4B024CA04 , 4B024HA14 , 4B063QA12 , 4B063QQ04 , 4B063QQ43 , 4B063QR08 , 4B063QR62 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B065AA89 , 4B065AB01 , 4B065BA01 , 4B065CA46 , 4B065CA53

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

分類および同定のためのオリゴヌクレオチドタグ
Gazette classification：公表公報 Application number：特願平9-501818 Applicant：リンクスセラピューティクス,インコーポレイテッド

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (13)

A Contiguous 66-kb Barley DNA Sequence Provides Evidence for Reversible Genome Expansion
Molecular Biology and Evolution, 2000, vol.17,No,4, p.499-510
Plant Physiology, 1998, vol.118,No1, p.37-49

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