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J-GLOBAL ID：200903014982180291

ポリペプチドがエネルギーにより切断される部位を予測する方法

Inventor： 福井 一彦 ,  秋山 泰 ,  高橋 勝利
Applicant, Patent owner： 独立行政法人産業技術総合研究所
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2002153559
Publication number (International publication number)：2003344416
Application date： May. 28, 2002
Publication date： Dec. 03, 2003
Summary：

【要約】【課題】 ポリペプチドが外部エネルギーにより切断される部位を予測する方法、ポリペプチドが外部エネルギーにより切断されて得られたペプチド断片を同定する方法、並びに、外部エネルギーによるポリペプチドの切断により所望のペプチド断片を取得する方法の提供を課題とする。【解決手段】 ab initio 分子軌道計算と分子動力学シミュレーションとを用いることにより、ポリペプチドの外部エネルギーによる切断部位を信頼性高く予測する。この予測に基づき、ポリペプチドが外部エネルギーにより切断されて得られたペプチド断片を同定する。また、この予測に基づき、外部エネルギーによるポリペプチドの切断により所望のペプチド断片を取得する。

Claim (excerpt)：

ポリペプチド中のペプチド結合が、該ポリペプチドに外部エネルギーを与えることにより、切断される指向性を算出する方法であって、(a)前記ポリペプチド中の連続する二つのアミノ酸残基からなるジペプチドの各々について、ペプチド結合の結合エネルギーを算出する工程、および、(b)前記外部エネルギーの値と工程(a)で算出された結合エネルギーの値とから、前記ポリペプチド中のペプチド結合が前記外部エネルギーにより切断される指向性を算出する工程、を含む方法。

IPC (6)：

G01N 33/68 ZNA ,  C07K 1/00 ,  C07K 2/00 ,  G01N 27/62 ,  G01N 33/48 ,  G06F 17/30 170

FI (6)：

G01N 33/68 ZNA ,  C07K 1/00 ,  C07K 2/00 ,  G01N 27/62 V ,  G01N 33/48 Z ,  G06F 17/30 170 F

F-Term (8)：

2G045AA34 ,  2G045DA36 ,  2G045FA34 ,  4H045AA10 ,  4H045AA20 ,  4H045HA02 ,  5B075ND20 ,  5B075UU18

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

• 質量分析方法および装置
  Gazette classification：公開公報   Application number：特願2001-175747   Applicant：マイクロマス・リミテッド