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J-GLOBAL ID：200903021488537221

一塩基多型(SNP)を含むポリヌクレオチド、該ポリヌクレオチドから成るイネ品種判別用SNPマーカー、及び、該SNP分析によるイネの品種判別方法

Inventor：
西尾 剛

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白澤 健太

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汐海 沙知子

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前田 寛明

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山口 誠之

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遠藤 貴司

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佐藤 秀樹

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Applicant, Patent owner：
株式会社 東北テクノアーチ

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独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構

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Agent (1)： 阿部 正博
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2007273032
Publication number (International publication number)：2009100653
Application date： Oct. 19, 2007
Publication date： May. 14, 2009
Summary：
【課題】一度に多数の試料を用いて、イネの品種判別(識別)を簡便にかつ低コストで実施できるようなSNP分析手段、並びに、該分析手段に使用する一塩基多型(SNP)を含むポリヌクレオチド(断片)及び該ポリヌクレオチドから成るイネ品種判別用変異型プローブを提供すること。【解決手段】イネの品種判別用SNPマーカーとして有用な特定の配列で示されるポリヌクレオチド、該ポリヌクレオチドから成るイネ品種判別用SNPマーカー及び該マーカーセット、並びに、該マーカーセット等を用いて該SNPを分析することによるイネの品種判別方法。【選択図】図1
Claim (excerpt)：
以下に示す58種類のポリヌクレオチドから成る群から選択されるいずれか一つのポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチド: (1)配列番号1で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (2)配列番号2で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (3)配列番号3で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (4)配列番号4で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (5)配列番号5で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (6)配列番号6で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (7)配列番号7で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (8)配列番号8で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (9)配列番号9で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (10)配列番号10で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (11)配列番号11で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (12)配列番号12で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (13)配列番号13で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (14)配列番号14で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (15)配列番号15で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (16)配列番号16で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (17)配列番号17で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (18)配列番号18で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (19)配列番号19で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (20)配列番号20で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (21)配列番号21で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (22)配列番号22で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (23)配列番号23で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (24)配列番号24で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (25)配列番号25で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (26)配列番号26で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (27)配列番号27で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (28)配列番号28で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (29)配列番号29で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (30)配列番号30で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (31)配列番号31で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (32)配列番号32で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (33)配列番号33で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (34)配列番号34で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (35)配列番号35で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (36)配列番号36で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (37)配列番号37で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (38)配列番号38で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (39)配列番号39で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (40)配列番号40で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (41)配列番号41で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (42)配列番号42で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (43)配列番号43で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (44)配列番号44で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (45)配列番号45で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa、10番目はg)において、9番目及び/又は10番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (46)配列番号46で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (47)配列番号47で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (48)配列番号48で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (49)配列番号49で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はa)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (50)配列番号50で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (51)配列番号51で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (52)配列番号52で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はc)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (53)配列番号53で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (54)配列番号54で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (55)配列番号55で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (56)配列番号56で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド; (57)配列番号57で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はt)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド;及び (58)配列番号58で表されるDNA配列からなるポリヌクレオチド(9番目はg)において、9番目の塩基を含む10〜17の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド。
IPC (3)：
C12N 15/09 ,  C12Q 1/68 ,  G01N 21/78
FI (3)：
C12N15/00 A ,  C12Q1/68 A ,  G01N21/78 Z
F-Term (20)：
2G054AA06 ,  2G054AB03 ,  2G054CA22 ,  2G054EA04 ,  2G054EA06 ,  2G054GB01 ,  2G054GB05 ,  4B024AA11 ,  4B024CA04 ,  4B024CA09 ,  4B024CA20 ,  4B024HA14 ,  4B063QA01 ,  4B063QQ04 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR08 ,  4B063QR55 ,  4B063QR62 ,  4B063QS25 ,  4B063QS34
Patent cited by the Patent：
Cited by applicant (12)
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