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J-GLOBAL ID：200903028067174604

コンセンサス配列の精度向上方法及びそれを用いたコンセンサス配列の決定方法

Inventor：
湯野川 春信

About 湯野川 春信

, 
笠間 康次

About 笠間 康次


Applicant, Patent owner：
株式会社メイズ

About 株式会社メイズ


Agent (1)： 谷川 英次郎
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2003050422
Publication number (International publication number)：2004259094
Application date： Feb. 27, 2003
Publication date： Sep. 16, 2004
Summary：
【課題】公知の方法よりもさらにコンセンサス配列の精度を簡便に高めることができる、コンセンサス配列の精度向上方法を提供すること。【解決手段】このコンセンサス配列の精度向上方法では、(1)データベースに格納されているmRNA及び/又はESTの塩基配列に基づいて得られたコンセンサス配列を、相同性検索プログラムによりゲノムデータベースに格納されているゲノム配列と比較する。次に、(2)上記(1)のステップにより見出されたゲノム配列中の領域の配列で、該領域に対応するコンセンサス配列中の領域を置き換える。【選択図】 図1
Claim (excerpt)：
(1)データベースに格納されているmRNA及び/又はESTの塩基配列に基づいて得られたコンセンサス配列を、相同性検索プログラムによりゲノムデータベースに格納されているゲノム配列と比較するステップ、(2)上記(1)のステップにより見出されたゲノム配列中の領域の配列で、該領域に対応するコンセンサス配列中の領域を置き換えるステップとを含む、コンセンサス配列の精度向上方法。
IPC (1)：
G06F17/30
FI (2)：
G06F17/30 170F ,  G06F17/30
F-Term (2)：
5B075ND02 ,  5B075UU19
Patent cited by the Patent：
Cited by examiner (3)
  • 転写配列を取得する方法
    Gazette classification：公開公報   Application number：特願2000-377888   Applicant：アイシン精機株式会社, 株式会社メイズ
  • 魚釣用電動リ-ル
    Gazette classification：公開公報   Application number：特願2000-381120   Applicant：ダイワ精工株式会社
  • ヒト組織に発現する完全長分子
    Gazette classification：公表公報   Application number：特願2000-618453   Applicant：インサイト・ゲノミックス・インコーポレイテッド
Article cited by the Patent：
Cited by examiner (3)
  • Phred/phrap/consed - アセンブルとエディティング
  • Phred/phrap/consed - アセンブルとエディティング
  • Phred/phrap/consed - アセンブルとエディティング

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