大腸癌リンパ節転移の有無を予測するための遺伝子セット

Inventor： , , , ,
Applicant, Patent owner： , , ,
Agent (3)：田村恭生 , 齋藤みの里 , 品川永敏
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2005222995
Publication number (International publication number)：2007037421
Application date： Aug. 01, 2005
Publication date： Feb. 15, 2007
Summary：

【課題】大腸癌のリンパ節転移の有無を予測するための方法及び当該方法に利用できる遺伝子セットの提供。【解決手段】下記(1)〜(4)の工程を含む、遺伝子セットの選択方法:(1)組織病理学的判定によりリンパ節転移の有無が明らかにされた患者の大腸癌原発巣組織における遺伝子発現情報を、リンパ節転移の有無を正分類率75%以上で分類できる遺伝子群をそれぞれの解析方法において選定する工程(2)(1)で用いた解析方法で選定された遺伝子群から、何れの解析方法でも共通して選定された共通遺伝子を選択する工程、(3)前記遺伝子発現情報を解析することにより、任意の2以上の遺伝子の組合せの中から、リンパ節転移の有無の分類を指示し、交互作用を示す遺伝子の組合わせを選択する工程、及び(4)前記共通遺伝子及び前記遺伝子の組合わせを説明変数としてリンパ節転移の有無を応答としたロジスティック回帰モデルにおける変数選択を行う工程。【選択図】なし

Claim (excerpt)：

下記(1)〜(4)の工程を含む、大腸癌リンパ節転移の有無を予測するための遺伝子セットの選択方法: (1)組織病理学的判定によりリンパ節転移の有無が明らかにされた患者の大腸癌原発巣組織における遺伝子発現情報を、教師あり学習解析方法を少なくとも一つ含む、4以上の解析方法で解析することにより、リンパ節転移の有無を正分類率75%以上で分類できる遺伝子群をそれぞれの解析方法において選定する工程、 (2)(1)で用いたそれぞれの解析方法で選定された遺伝子群から、何れの解析方法でも共通して選定された共通遺伝子を選択する工程、 (3)前記遺伝子発現情報を解析することにより、任意の2以上の遺伝子の組合せの中から、リンパ節転移の有無の分類を指示し、交互作用を示す遺伝子の組合わせを選択する工程、及び (4)前記共通遺伝子及び前記遺伝子の組合わせを説明変数として、リンパ節転移の有無を応答としたロジスティック回帰モデルにおける変数選択を行う工程。

IPC (2)：

C12Q 1/68 , C12N 15/09

FI (2)：

C12Q1/68 A , C12N15/00 A

F-Term (20)：

4B024AA11 , 4B024CA01 , 4B024CA04 , 4B024CA09 , 4B024CA11 , 4B024CA20 , 4B024HA12 , 4B063QA01 , 4B063QA13 , 4B063QA17 , 4B063QA18 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QR82 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B063QS36 , 4B063QX02

Patent cited by the Patent：

Cited by applicant (1)

大腸癌の肝転移を予測するための遺伝子セット
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2002-193381 Applicant：竹政伊知朗, 財団法人化学及血清療法研究所, 株式会社DNAチップ研究所

Cited by examiner (1)

大腸癌の肝転移を予測するための遺伝子セット
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2002-193381 Applicant：竹政伊知朗, 財団法人化学及血清療法研究所, 株式会社DNAチップ研究所

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (7)

日本分子生物学会年会プログラム, 2004, Vol.27, p.1019
BMC Bioinformatics, 2004, 5:81, pp.1-12
Bioinformatics, 2003, Vol.19, No.18, pp.2465-2472

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