質量分析を使用する発現の定量化

Inventor： , , , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (3)：山本秀策 , 安村高明 , 森下夏樹
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2007527484
Publication number (International publication number)：2007538262
Application date： May. 19, 2005
Publication date： Dec. 27, 2007
Summary：

種々の局面において、本教示は、タンパク質発現の絶対定量のためのシステム、方法、アッセイ、およびキットを提供する。種々の局面において、本教示は、1つまたはそれ以上の目的のサンプル中の1つまたはそれ以上の目的のタンパク質の濃度を求める方法を提供する。種々の局面において、本教示は、特徴的タンパク質フラグメントの標準試料および親-娘イオントランジションモニタリング(PDITM)を使用して、タンパク質の1つまたはそれ以上のアイソフォームの絶対濃度を求める方法を提供する。種々の実施形態において、1つのサンプル中の生体分子の複数のアイソフォームの絶対濃度、生物学的プロセスや複数のサンプルを組み合わせたものにおける複数のタンパク質の絶対濃度、またはそれらを組み合わせたものを、本教示を使用した複合的な方法で求めることができる。化学物質に対する生物学的システムの応答を評価する方法を提供する。

Claim (excerpt)：

2つまたはそれ以上のサンプル中の1つまたはそれ以上の目的のタンパク質の濃度を求める方法であって、 1つまたはそれ以上の目的のタンパク質のそれぞれに対して、対応する目的のタンパク質に対する特徴的ペプチドを含む標準試料を用意する工程と、各特徴的ペプチドに対して識別用娘イオンを選択する工程と、各選択された識別用娘イオンに対して濃度曲線を作成する工程と、該2つまたはそれ以上のサンプル中の1つまたはそれ以上の目的のタンパク質を、各サンプルに対して異なる標識によって標識化することにより、その2つまたはそれ以上のサンプルが差次的に標識化される工程と、該差次的に標識化された複数のサンプルの少なくとも一部を混合して混合サンプルを作成する工程と、該混合サンプルの少なくとも一部をクロマトグラフィカラムにかける工程と、該クロマトグラフィカラムからの溶離液の少なくとも一部を多重反応モニタリングに供する工程であって、各多重反応モニタリングスキャンの通過親イオンのm/z範囲は、該特徴的ペプチドのうちの1つまたはそれ以上の特徴的ペプチドのm/z値を含み、各多重反応モニタリングスキャンの通過娘イオンのm/z範囲は、通過した特徴的ペプチドに対応する該選択された識別用娘イオンのうちの1つまたはそれ以上の識別用娘イオンのm/z値を含む工程と、該多重反応モニタリングを使用して、該選択された識別用娘イオンのうちの1つまたはそれ以上の選択された識別用娘イオンのイオン信号を測定する工程と、該2つまたはそれ以上のサンプルのうちの1つまたはそれ以上のサンプル中の目的のタンパク質の絶対濃度を、当該目的のタンパク質に対応する選択された識別用娘イオンの測定されたイオン信号とその選択された識別用娘イオンに対する濃度曲線とを少なくとも比較することにより求める工程と、を含む、方法。

IPC (3)：

G01N 27/62 , G01N 30/88 , C12Q 1/26

FI (4)：

G01N27/62 V , G01N27/62 X , G01N30/88 J , C12Q1/26

F-Term (29)：

2G041CA01 , 2G041DA02 , 2G041DA04 , 2G041DA05 , 2G041DA09 , 2G041DA18 , 2G041EA04 , 2G041FA12 , 2G041GA03 , 2G041GA06 , 2G041GA08 , 2G041GA09 , 2G041GA10 , 2G041HA01 , 2G041JA02 , 2G041JA09 , 2G041JA15 , 2G041KA01 , 2G041LA07 , 4B063QA01 , 4B063QQ22 , 4B063QR02 , 4B063QS17 , 4B063QS39 , 4B063QX04 , 4H045BA15 , 4H045BA16 , 4H045BA17 , 4H045EA20

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

超高感度検出システム
Gazette classification：公表公報 Application number：特願2002-519945 Applicant：アジリックス・コーポレイション

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (4)

Absolute quantification of proteins and phosphoproteins from cell lysates by tandem MS
Absolute Quantification of the G Protein-Coupled Receptor Rhodopsin by LC/MS/MS Using Proteolysis Pr
Quantitation of human glutathione S-transferases in complex matrices by liquid chromatography/tandem

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