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J-GLOBAL ID:200903068345209211

ジャガイモそうか病原因菌種の16SrRNA遺伝子若しくは16SrRNA遺伝子からITS領域間を増幅するための新規プライマー対、及びそれらを用いたジャガイモそうか病原因菌種の検出・識別方法

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (2): 近藤 利英子 ,  吉田 勝広
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2005032067
Publication number (International publication number):2006217828
Application date: Feb. 08, 2005
Publication date: Aug. 24, 2006
Summary:
【課題】複数のジャガイモそうか病菌種のゲノムDNAを菌種特異的に増幅できるPCR用のプライマー対、及びそれを用いて、そうか病罹患の塊茎の病斑組織における菌種の特定、又ジャガイモ畑等のそうか病菌種の存在の有無及び菌種の特定、また、培養そうか病菌の特定、を迅速・簡便かつ安価に行う方法を提供すること。【解決手段】そうか病菌種の16S rRNA遺伝子及び16S-23S内部転写スペーサー(ITS)領域の菌種特異的塩基配列にハイブリダイズし、増幅されるべきDNA断片サイズ(base pairs)が菌種間で明瞭に異なるPCR用プライマー対、それらを用いることによる、ハイブリダイズしたプライマー間のゲノムDNAの増幅方法、更に増幅産物の識別方法を提供する。【選択図】 なし
Claim (excerpt):
ジャガイモそうか病(以下、単にそうか病という。)菌種Streptomyces scabieiの16S rRNA遺伝子に特異的にハイブリダイズし、かつ下記の塩基配列を有する、当該菌種の16S rRNA遺伝子から16S-23S内部転写スペーサー(internal transcribed spacer:ITS)領域(以下、単にITS領域という。)間を増幅するためのPCR用フォワードプライマー(Sca-F)と、当該菌種のITS領域に特異的にハイブリダイズし、かつ下記の塩基配列を有する、当該菌種の16S rRNA遺伝子からITS領域間を増幅するためのPCR用リバースプライマー(Sca-R)からなる新規なプライマー対。 Sca-F:cggtggccya acccgtaag (5'→3') (y:t/u又はc) Sca-R:ttccacaccc acaaggggta gt (5'→3')
IPC (2):
C12N 15/09 ,  C12Q 1/68
FI (2):
C12N15/00 A ,  C12Q1/68 A
F-Term (19):
4B024AA07 ,  4B024AA11 ,  4B024CA01 ,  4B024CA09 ,  4B024CA11 ,  4B024CA20 ,  4B024GA27 ,  4B024HA14 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ06 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR32 ,  4B063QR55 ,  4B063QR62 ,  4B063QR75 ,  4B063QS25 ,  4B063QS34 ,  4B063QX01
Article cited by the Patent:
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