ジャガイモそうか病原因菌種の16SrRNA遺伝子若しくは16SrRNA遺伝子からITS領域間を増幅するための新規プライマー対、及びそれらを用いたジャガイモそうか病原因菌種の検出・識別方法

Inventor： , , , , ,
Applicant, Patent owner： ,
Agent (2)：近藤利英子 , 吉田勝広
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2005032067
Publication number (International publication number)：2006217828
Application date： Feb. 08, 2005
Publication date： Aug. 24, 2006
Summary：

【課題】複数のジャガイモそうか病菌種のゲノムDNAを菌種特異的に増幅できるPCR用のプライマー対、及びそれを用いて、そうか病罹患の塊茎の病斑組織における菌種の特定、又ジャガイモ畑等のそうか病菌種の存在の有無及び菌種の特定、また、培養そうか病菌の特定、を迅速・簡便かつ安価に行う方法を提供すること。【解決手段】そうか病菌種の16S rRNA遺伝子及び16S-23S内部転写スペーサー(ITS)領域の菌種特異的塩基配列にハイブリダイズし、増幅されるべきDNA断片サイズ(base pairs)が菌種間で明瞭に異なるPCR用プライマー対、それらを用いることによる、ハイブリダイズしたプライマー間のゲノムDNAの増幅方法、更に増幅産物の識別方法を提供する。【選択図】なし

Claim (excerpt)：

ジャガイモそうか病(以下、単にそうか病という。)菌種Streptomyces scabieiの16S rRNA遺伝子に特異的にハイブリダイズし、かつ下記の塩基配列を有する、当該菌種の16S rRNA遺伝子から16S-23S内部転写スペーサー(internal transcribed spacer:ITS)領域(以下、単にITS領域という。)間を増幅するためのPCR用フォワードプライマー(Sca-F)と、当該菌種のITS領域に特異的にハイブリダイズし、かつ下記の塩基配列を有する、当該菌種の16S rRNA遺伝子からITS領域間を増幅するためのPCR用リバースプライマー(Sca-R)からなる新規なプライマー対。 Sca-F:cggtggccya acccgtaag (5'→3') (y:t/u又はc) Sca-R:ttccacaccc acaaggggta gt (5'→3')

IPC (2)：

C12N 15/09 , C12Q 1/68

FI (2)：

C12N15/00 A , C12Q1/68 A

F-Term (19)：

4B024AA07 , 4B024AA11 , 4B024CA01 , 4B024CA09 , 4B024CA11 , 4B024CA20 , 4B024GA27 , 4B024HA14 , 4B063QA01 , 4B063QA18 , 4B063QQ06 , 4B063QQ42 , 4B063QR32 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QR75 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B063QX01

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (8)

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