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J-GLOBAL ID:200903082488116241

メタン発酵微生物系の評価のためのヌクレオチドプライマーおよびそれらを用いた評価法

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (8): 社本 一夫 ,  小野 新次郎 ,  栗田 忠彦 ,  桜井 周矩 ,  細川 伸哉 ,  松山 美奈子 ,  小磯 貴子 ,  中村 充利
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2006098167
Publication number (International publication number):2006325581
Application date: Mar. 31, 2006
Publication date: Dec. 07, 2006
Summary:
【課題】メタン発酵微生物系においてメタン生成に関連する主要な微生物の動態解析に好適な定量検出手段になるヌクレオチドプライマーおよびそれらを用いたメタン発酵微生物系の評価法、さらにはその安定運転のために微生物動態をモニタリングおよび制御するのに役立つ指標を提供する。【解決手段】メタン発酵微生物系における微生物処理活性を評価する方法であって、メタン発酵微生物系からサンプリングされた核酸試料を対象にして、特定のオリゴヌクレオチドプライマーを使用してPCR法を行うことにより、該メタン発酵微生物系においてメタン生成に関与する菌群を検出すること含む評価方法。【選択図】なし
Claim (excerpt):
メタン生成菌を属または科レベルでターゲットとする下記(a)〜(e)に記載のいずれか1組のオリゴヌクレオチドを含むプライマーセット: (a)Methanosarcina属の菌群を検出するための配列番号1の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号2の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチド; (b)Methanosaetaceae科の菌群を検出するための配列番号3の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号4の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチド; (c)Methanomicrobiaceae科のMethanoculleus属およびMethanogenium属の菌群を検出するための配列番号5の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号6の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチド; (d)Methanomicrobiales目のMethanospirillaceae科の菌群を検出するための配列番号7の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号8の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチド;および (e)Methanobacteriaceae科の菌群を検出するための配列番号9の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号10の塩基配列又はそれと実質的に相同な塩基配列を有するオリゴヌクレオチド。
IPC (4):
C12N 15/09 ,  C12Q 1/68 ,  C02F 11/04 ,  C02F 3/28
FI (4):
C12N15/00 A ,  C12Q1/68 A ,  C02F11/04 Z ,  C02F3/28 Z
F-Term (25):
4B024AA11 ,  4B024AA17 ,  4B024BA80 ,  4B024CA09 ,  4B024HA12 ,  4B063QA05 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ06 ,  4B063QQ18 ,  4B063QQ20 ,  4B063QQ43 ,  4B063QR08 ,  4B063QR32 ,  4B063QR42 ,  4B063QR55 ,  4B063QR62 ,  4B063QS25 ,  4B063QS34 ,  4B063QX01 ,  4D040AA01 ,  4D040AA31 ,  4D040AA61 ,  4D059AA07 ,  4D059BA12 ,  4D059EA20
Patent cited by the Patent:
Cited by applicant (3)

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