微生物識別装置及び微生物識別方法並びに微生物識別プログラム

Inventor： ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：吉田研二 (外2名)
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2002053473
Publication number (International publication number)：2002335963
Application date： Feb. 28, 2002
Publication date： Nov. 26, 2002
Summary：

【要約】【課題】電気泳動像から得られた輝度分布の波形データをデータベースと照合してサンプルの微生物を識別する。【解決手段】 SSC-PCR増幅・解析装置1でサンプルのDNA断片を増幅し、電気泳動像を得る。電気泳動動は電気泳動イメージ入力部2で画像データに変換され、解析用コンピュータ3に取り込まれる。解析用コンピュータ3は、サンプル波形データとデータベース格納部4に格納された標準波形データとの相関を演算し、相関(類似度)の大きいものを選択して結果表示手段5に表示する。サンプル波形データのうち、ピークが一致する部分と標準波形データの全体との相関演算、あるいはサンプル波形データと標準波形データのピークが一致する部分のみの相関演算を用いて選択する。

Claim (excerpt)：

複数のプライマーの各々を用いて増幅されたサンプルDNAのサイズに依存した濃度分布を示すサンプル波形データとデータベースに記憶された標準波形データとを照合することにより微生物を識別する装置であって、前記サンプル波形データのうち、前記標準波形データと一致する部分を抽出する抽出手段と、前記サンプル波形データの一致する部分を用いて前記サンプル波形データと前記標準波形データの相関を演算する演算手段と、を有することを特徴とする微生物識別装置。

IPC (4)：

C12N 15/09 , C12M 1/00 , C12M 1/34 , C12Q 1/68

FI (4)：

C12M 1/00 A , C12M 1/34 B , C12Q 1/68 A , C12N 15/00 A

F-Term (23)：

4B024AA11 , 4B024CA01 , 4B024GA19 , 4B024HA11 , 4B029AA07 , 4B029AA23 , 4B029BB01 , 4B029BB20 , 4B029CC01 , 4B029FA15 , 4B063QA01 , 4B063QA18 , 4B063QQ05 , 4B063QQ42 , 4B063QR32 , 4B063QR38 , 4B063QS16 , 4B063QS17 , 4B063QS20 , 4B063QS25 , 4B063QS36 , 4B063QS40 , 4B063QX01

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

微生物識別方法、微生物識別装置、微生物識別用データベースの作成方法および微生物識別プログラムを記録した記録媒体
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2000-099482 Applicant：三洋電機株式会社, 社団法人農林水産先端技術産業振興センター
特開平2-269951

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (6)

"Polymerase chain Reaction with universal primers for studying genomes"
"GelCompar II"
Electrophoresis

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