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J-GLOBAL ID：201103023649306641

遺伝子の類縁性検索方法および遺伝子の類縁性検索システム

Inventor： 渡邊 克二 ,  奥田 充
Applicant, Patent owner： 独立行政法人農業技術研究機構 ,  渡邊 克二
Agent (1)： 志賀 正武 (外6名)
Gazette classification：特許公報
Application number (International application number)：2000215134
Publication number (International publication number)：2002032377
Patent number：3431135
Application date： Jul. 14, 2000
Publication date： Jan. 31, 2002
Claim (excerpt)：

【請求項1】 プライマによって増幅される前の既知遺伝子の塩基配列が保持されている増幅前塩基配列データを読み込み、当該プライマの塩基配列を表すプライマデータを基に、当該既知遺伝子から当該プライマで増幅される増幅後塩基配列データを生成する増幅配列認識部と、制限酵素の種別と当該制限酵素が切断する切断箇所の塩基配列パターンと当該塩基配列パターン内における切断位置とが関連付けられて保持されている制限酵素データと、既知遺伝子の種別と当該既知遺伝子の前記増幅後塩基配列データとが関連付けられて保持されている塩基配列データとを基に、当該既知遺伝子を当該制限酵素で切断したときの切断長理論値を計算して、既知遺伝子の種別と制限酵素の種別と当該既知遺伝子を当該制限酵素で切断したときの切断長理論値とが関連付けられて保持された切断長理論値データとして出力する理論値計算部と、前記切断長理論値データと、制限酵素の種別と当該制限酵素を用いて試料を切断して測定した結果得られた切断長実測値とが関連付けられて保持されている切断長実測値データとを比較することにより、当該既知遺伝子と当該試料との類似度を算出して解析結果データとして出力する比較部とを備えることを特徴とする塩基配列類縁性検索システム。

IPC (3)：

G06F 17/30 170 ,  G06F 17/30 210 ,  C12N 15/09 ZNA

FI (3)：

G06F 17/30 170 F ,  G06F 17/30 210 D ,  C12N 15/00 ZNA A

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

• DNA解析法
  Gazette classification：公開公報   Application number：特願平9-074983   Applicant：株式会社日立製作所