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J-GLOBAL ID：201201044016566501   Update date: Sep. 18, 2024

Ogishima Soichi

オギシマ ソウイチ | Ogishima Soichi
Affiliation and department：
Tohoku University Advanced Research Center for Innovations in Next-Generation Medicine / Medical Megabank Organization Department of Health Record InformaticsInformatics, Department of Informatics for Genomic Medicine

About Tohoku University Advanced Research Center for Innovations in Next-Generation Medicine / Medical Megabank Organization Department of Health Record InformaticsInformatics, Department of Informatics for Genomic Medicine


Job title： Professor
Other affiliations (5)：
Homepage URL  (1)： http://www.igm.megabank.tohoku.ac.jp/
Research field  (3)： Systems genomics ,  Genomics ,  Biological, health, and medical informatics
Research keywords  (4)： Medical Informatics ,  Systems Biology ,  Translational Bioinformatics ,  Bioinformatics
Research theme for competitive and other funds  (19)：
  • 2021 - 2024 多因子疾患の環境曝露の発症機序への影響の深層学習によるシステム的解明
  • 2018 - 2023 ゲノム医療実現推進のためのバイオバンク利活用促進に向けたバイオバンク・ネットワーク構築 と運用支援に関する研究開発
  • 2019 - 2022 The establishment of the trust among stakeholders and patients for sharing the medical and genomic records by centralized and decentralized storage methods
  • 2018 - 2021 日本人のゲノム・健康・診療情報と公共知識ベースのセマンティック統合システムの開発
  • 2016 - 2019 Bioinformatics analysis of disease attractors and gene regulatory networks of Alzheimer's disease
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Papers (112)：
  • Mitsuhiro Yamada, Masato Takase, Kumi Nakaya, Tomohiro Nakamura, Mana Kogure, Naoki Nakaya, Naoya Fujino, Tsutomu Tamada, Chikashi Iwasaki, Manami Suzuki, et al. Fractional exhaled nitric oxide distribution and its relevant factors in the general adult population and its healthy subpopulation. The journal of allergy and clinical immunology. Global. 2024. 3. 3. 100253-100253
  • Kumi Nakaya, Naoki Nakaya, Mana Kogure, Rieko Hatanaka, Ippei Chiba, Ikumi Kanno, Satoshi Nagaie, Tomohiro Nakamura, Motoyori Kanazawa, Soichi Ogishima, et al. Factors Associated With the Prevalence of Irritable Bowel Syndrome: The Miyagi Part of the Tohoku Medical Megabank Project Community-based Cohort Study. Journal of neurogastroenterology and motility. 2024. 30. 2. 208-219
  • Satoshi Mizuno, Maiko Wagata, Satoshi Nagaie, Mami Ishikuro, Taku Obara, Gen Tamiya, Shinichi Kuriyama, Hiroshi Tanaka, Nobuo Yaegashi, Masayuki Yamamoto, et al. Development of phenotyping algorithms for hypertensive disorders of pregnancy (HDP) and their application in more than 22,000 pregnant women. Scientific reports. 2024. 14. 1. 6292-6292
  • Tetsuya Akaishi, Kumi Nakaya, Naoki Nakaya, Mana Kogure, Rieko Hatanaka, Ippei Chiba, Sayuri Tokioka, Satoshi Nagaie, Soichi Ogishima, Atsushi Hozawa. Low Hemoglobin Level and Elevated Inflammatory Hematological Ratios Associated With Depression and Sleep Disturbance. Cureus. 2024. 16. 3. e56621
  • Masato Takase, Naoki Nakaya, Kozo Tanno, Mana Kogure, Rieko Hatanaka, Kumi Nakaya, Ippei Chiba, Ikumi Kanno, Kotaro Nochioka, Naho Tsuchiya, et al. Relationship between traditional risk factors for hypertension and systolic blood pressure in the Tohoku Medical Megabank Community-based Cohort Study. Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension. 2024
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MISC (122)：
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Books (27)：
  • がんゲノムペディア : 77のキーワードで理解するゲノム医療とゲノム研究
    羊土社 2024 ISBN:9784758121309
  • 季刊誌「遺伝子医学」通巻47号・復刊22号(2024年1月発行) 特集「ゲノム医療におけるバイオバンクの役割とその利活用 」:わが国のバイオバンクの現状とバイオバンク・ネットワークによる利活用システムの構築
    メディカル・ドゥ 2024 ISBN:9784909508270
  • ヒト生体試料・データ取扱い実践ハンドブック : 適切なサンプル・データ取得からバイオバンク利活用、法規制まで、必須知識と標準フローをこの1冊に凝縮
    羊土社 2023 ISBN:9784758122658
  • 月刊PHARMSTAGE 2023年6月号 ゲノム情報・医療情報の統合による個別化ヘルスケアに向けたTR研究への活用
    技術情報協会 2023
  • 革新的AI創薬 : 医療ビッグデータ、人工知能がもたらす創薬研究の未来像
    エヌ・ティー・エス 2022 ISBN:9784860437886
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Lectures and oral presentations  (211)：
  • ゲノム社会における医療・健診を通じた個別化予防・医療の実現へ
    (Hospital Management Japan Summit 2024 2024)
  • Research and development platform toward data-enabled health system
    (「デジタル技術による医療変革の最前線」 第6回 LINK-J・UCサンディエゴ ライフサイエンスシンポジウム 2024)
  • データの取扱い(第1回)
    (バイオメディカルセミナー<データ取扱い編> 2024)
  • Biobank network in Japan to accelerate progress towards genomic medicine
    (EUROPE BIOBANK WEEK 2024 2024)
  • データ基盤構築と医療・健康データ等の利活用
    (共創の場形成支援プログラム 共創分野・地域共創分野 第 1 回 領域ワークショップ「医療・健康データ等の利活用」 2024)
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Education (4)：
  • 2001 - 2005 Tokyo Medical and Dental University Graduate School of Medical and Dental Sciences Dept. of Bioinformatics
  • 1999 - 2001 Tokyo Medical and Dental University Medical Research Institute
  • 1996 - 1999 The University of Tokyo The Faculty of Engineering Department of Mathematical Engineering and Information Physics
  • 1994 - 1996 The University of Tokyo College of Arts and Sciences
Professional career (1)：
  • 博士(医学) (東京医科歯科大学)
Work history (11)：
  • 2020/03 - 現在 Tohoku University The Advanced Research Center for Innovations in Next-Generation Medicine (INGEM) Professor
  • 2018/04 - 現在 Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University , Dept. of Informatics for Genomic Medicine Professor
  • 2024/04 - 2025/03 Osaka University
  • 2023/09 - 2025/03 Hokkaido University
  • 2006/04 - 2022/03 Tokyo Medical and Dental University
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Committee career (71)：
  • 2020/05 - 現在 HL7 Japan Technical Committee Genome WG Chairperson
  • 2019/06 - 現在 Japan Society for Omics-based Medicine Board Member
  • 2018/05 - 現在 がんゲノム医療中核病院WG 患者情報登録WG 構成員
  • 2018/05 - 現在 がんゲノム医療中核病院WG 委員
  • 2016 - 現在 一般社団法人 日本ユーザビリティ医療情報化推進協議会(JUMP)ゲノムが作る新たな医療推進委員会 委員
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Awards (3)：
  • 2017/09 - 情報処理学会DICOMO2017実行委員会 最優秀論文賞 プライバシ保護ゲノム解析のための秘密計算フィッシャー正確検定の実装評価
  • 2012 - Oxford Journals Japanese Society for Bioinformatics Prize 2012
  • 2011 - Asia Pacific Bioinformatics Conference 2011 the Best Poster Award
Association Membership(s) (5)：
Japan Open Bioinformatics Research Group ,  JAPAN ASSOCIATION FOR MEDICAL INFORMATICS ,  Japan Society for Omics-based Medicine ,  The Chem-Bio Informatics Society ,  JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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