遺伝子絞り込み装置、遺伝子絞り込み方法、及びコンピュータプログラム

Inventor： , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：井戸篤史
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2011184289
Publication number (International publication number)：2012069104
Application date： Aug. 26, 2011
Publication date： Apr. 05, 2012
Summary：

【課題】ある特定の機能や関連性を持った候補遺伝子の中から、より可能性が高い遺伝子を絞り込むことができる遺伝子絞り込み装置、遺伝子絞り込み方法、及びプログラムを提供する。【解決手段】本発明の遺伝子絞り込み装置は、記憶手段と、入力手段と、処理手段とを備え、記憶手段は、複数の生物学的情報が格納され、一の遺伝子又はタンパク質に該情報から得られた複数のアノテーションが付与されたデータウェアハウスを記憶し、入力手段は、複数の候補遺伝子又は候補タンパク質が情報として入力され、処理手段は、(a)アノテーションを収集する収集処理と、(b)付与の頻度又は数が閾値より高いアノテーションを選択する第1選択処理と、(c)遺伝子を選択する第2選択処理と、を実行する。【選択図】図1

Claim (excerpt)：

複数の候補遺伝子又は候補タンパク質から任意の関連性を有する遺伝子又はタンパク質を絞り込む遺伝子絞り込み装置であって、記憶手段と、入力手段と、処理手段とを備え、前記記憶手段は、複数の生物学的情報が格納され、一の遺伝子又はタンパク質に該情報から得られた複数のアノテーションが付与されたデータウェアハウスを記憶し、前記入力手段は、複数の候補遺伝子又は候補タンパク質が情報として入力され、前記処理手段は、 (a)前記記憶手段に記憶された前記データウェアハウスから、前記入力手段から入力された前記候補遺伝子又は前記候補タンパク質に付与されたアノテーションを収集する収集処理と、 (b)前記収集処理で収集されたアノテーションの中から、前記入力手段から得られた前記候補遺伝子又は前記候補タンパク質における付与の頻度又は数が閾値より高いアノテーションを1又は複数選択する第1選択処理と、 (c)前記入力手段から得られた前記候補遺伝子又は前記候補タンパク質の中から、前記選択処理で選択されたアノテーションが付与された遺伝子又はタンパク質を選択する第2選択処理と、を実行することを特徴とする、遺伝子絞り込み装置

IPC (2)：

G06F 19/22 , G06F 17/30

FI (2)：

G06F19/00 622 , G06F17/30 170F

F-Term (14)：

4B029AA07 , 4B029BB20 , 4B029CC01 , 4B029FA15 , 4B063QA01 , 4B063QA13 , 4B063QA18 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QQ79 , 4B063QR32 , 4B063QR35 , 4B063QS25 , 4B063QS39

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (4)

遺伝子発現データ解析方法
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2002-183810 Applicant：株式会社日立製作所
情報処理装置および方法、並びにプログラム
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2007-319212 Applicant：ソニー株式会社
表現型に関連する候補遺伝子の探索システム
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2006-081255 Applicant：社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム, 株式会社シーズ・ラボ, 独立行政法人産業技術総合研究所

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