Iida Keita

イイダケイタ | Iida Keita

Affiliation and department：
Job title： Associate Professor

Research field (2)： Applied mathematics and statistics , Basic mathematics

Research keywords (3)： Applied mathematics , Mathematical Physics , Bioinformatics

Research theme for competitive and other funds (8)：

2023 - 2026 臨床検体×空間オミクス解析×疾患iPS細胞の融合による拘束型心筋症の病態解明と治療法の探索
2022 - 2026 オミクスデータの記号学的分類を可能にする数理研究
2020 - 2023 がん可塑性の機構解明に向けた知識データ活用型の革新的オミクス解析
2020 - 2023 Quantifying and clarifying gene regulatory structure from single-cell level data
2021 - 2021 Workshop on omics analysis: experiment and mathematics

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Papers (17)：

Masamune Masuda, Keita Iida, Sadahiro Iwabuchi, Mie Tanaka, Satoshi Kubota, Hiroyuki Uematsu, Kunishige Onuma, Yoji Kukita, Kikuya Kato, Shoji Kamiura, et al. Clonal origin and lineage ambiguity in mixed neuroendocrine carcinoma of the uterine cervix. The American Journal of Pathology. 2023
Masatoshi Haga, Keita Iida, Mariko Okada. Positive and negative feedback regulation of the TGF-β1-SMAD4 axis explains two equilibrium states in human skin aging. bioRxiv. 2023
Roberto Coppo, Jumpei Kondo, Keita Iida, Mariko Okada, Kunishige Onuma, Yoshihisa Tanaka, Mayumi Kamada, Masayuki Ohue, Kenji Kawada, Kazutaka Obama, et al. Distinct but interchangeable subpopulations of colorectal cancer cells with different growth fates and drug sensitivity. iScience. 2023. 26. 2. 1-25
Kazuki Takahashi, Katarzyna A. Podyma-Inoue, Maki Saito, Shintaro Sakakitani, Akinari Sugauchi, Keita Iida, Sadahiro Iwabuchi, Daizo Koinuma, Kyoko Kurioka, Toru Konishi, et al. TGF-β generates a population of cancer cells residing in G1 phase with high motility and metastatic potential via KRTAP2-3. Cell Reports. 2022. 40. 13. 1-16
Keita Iida, Jumpei Kondo, Johannes Nicolaus Wibisana, Masahiro Inoue, Mariko Okada. ASURAT: functional annotation-driven unsupervised clustering of single-cell transcriptomes. Bioinformatics. 2022. 38. 18. 4330-4336

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MISC (15)：

井上カタジナアンナ, 高橋和樹, 須河内昭成, 飯田渓太, 岩淵禎弘, 鯉沼代造, 栗岡恭子, 小西徹, 田中晋, 戒田篤志, et al. がん研究における女性研究者 TGF-βは増殖が低下して運動能が上昇したがん細胞集団を形成することで口腔がんの転移を亢進する(TGF-β enhances metastasis of oral cancer via generation of a population of cancer cells in G1 phase with high motility). 日本癌学会総会記事. 2022. 81回. SS1-5
陳ヨ, 岩淵禎弘, 清野透, 平岡伸介, 飯田渓太, 新井康仁, 横山明彦, 岡田眞里子, 橋本真一, 大木理恵子. PHLDA3は膵島細胞の分化と代謝を制御することで非機能性膵神経内分泌腫瘍の悪性化を抑制する(PHLDA3 suppresses the malignant progression of non-functional PanNET by regulating cell differentiation and metabolism). 日本癌学会総会記事. 2022. 81回. P-2033
陳ヨ, 岩淵禎弘, 清野透, 平岡伸介, 飯田渓太, 新井康仁, 横山明彦, 岡田眞里子, 橋本真一, 仙波憲太郎, et al. PHLDA3機能欠損によるAktの活性化は細胞の分化と代謝異常を引き起こし、膵臓神経内分泌腫瘍の悪性化を促進する. 日本癌学会総会記事. 2021. 80回. [J4-3]
Jun Yasuda, Keita Iida, Kazuki Kumada, Soichi Ogishima, Yusuke Shibuya, Hideki Tokunaga, Nobuo Yaegashi. Variants of uncertain significance of the cancer-predisposing genes in two thousand Japanese whole-genome sequencing data. CANCER RESEARCH. 2018. 78. 13
水野聖士, 永家聖, 飯田渓太, 笠原直子, 田宮元, 栗山進一, 八重樫伸生, 田中博, 菅原準一, 荻島創一. 妊娠高血圧症候群(HDP)フェノタイピングのためのアルゴリズムの検討. 日本疫学会学術総会講演集(Web). 2018. 28th. 133 (WEB ONLY)

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Books (5)：

改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ
羊土社 2023 ISBN:9784758122672
生体の科学:未病の科学
医学書院 2023
実験医学別冊:空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド
羊土社 2022 ISBN:9784758122610
医学のあゆみ:1細胞解析-技術と応用
医歯薬出版株式会社 2021
Self-organized Motion: Physicochemical Design based on Nonlinear Dynamics
Royal Society of Chemistry Book 2018 ISBN:9781788011662

Lectures and oral presentations (72)：

1細胞トランスクリプトームの記号学的分類
(定量生物学の会第十一回年会 2024)
1細胞オミクス解析における記号学の応用可能性
(第63回生物物理夏の学校 2023)
Functional annotation-driven unsupervised clustering for single-cell data
(10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics (ICIAM 2023 TOKYO) 2023)
シングルセルデータを生物機能の空間で解析するソフトウェア ASURAT の紹介
(第6回OUバイオインフォマティクスセンターセミナー 2023)
がん可塑性の機構解明に向けた知識データ活用型の革新的オミクス解析
(蛋白質研究所新分野開拓支援プログラム成果報告会 2023)

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Works (2)：

ASURAT
Keita Iida 2022 -
Immune Cell Quest

Work history (8)：

2023/04 - 現在 Osaka University Laboratory for Cell Systems, Institute for Protein Research, Osaka University Associate Professor
2019/04 - 2023/03 Osaka University Laboratory for Cell Systems, Institute for Protein Research, Osaka University Assistant Professor
2018/07 - 2019/03 University of Tokyo Institute of industrial science, Laboratory for Quantitative Biology Project assistant professor
2017/01 - 2018/06 Tohoku University Tohoku Medical Megabank Organization Additional
2017/01 - 2018/06 Tohoku University International Research Institute of Disaster Science, Department of Disaster Psychiatry Assistant Professor

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Awards (2)：

2020/02 - The Mathematical Society of Japan The 2019 MSJ Prize for Exellent Applied Mathematicians
2018/12 - Editage Edge Editage Edge Fundamental Research Grant

Association Membership(s) (2)：

The Mathematical Society of Japan , The Japanese Cancer Association

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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