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J-GLOBAL ID：201401027638592804
Update date: Feb. 04, 2025
Hosokawa Masahito
ホソカワ マサヒト | Hosokawa Masahito
Affiliation and department：
Job title：
Associate Professor
Other affiliations (1)：
-
bitBiome, Inc.
Founder/CSO
Homepage URL (1)：
https://www.hosokawa-lab.com/
Research field (1)：
Applied biofunctional and bioprocess engineering
Research theme for competitive and other funds (22)：
- 2024 - 2029 Genomic regulation of intracellular symbiotic organelles: from technological innovation to understanding and application of life phenomena
- 2024 - 2029 Development of Techniques for Cytoplasmic Genome Modification
- 2024 - 2028 Initial host cell response to the plasmid recruited by conjugation
- 2023 - 2028 Elucidation of mucosal barrier regulation by intestinal microbiota
- 2022 - 2028 大規模1細胞ゲノムから設計する微生物叢の戦略的制御
- 2023 - 2027 Exploration of the limits and adaptations of life in subseafloor biosphere
- 2023 - 2027 肺炎球菌の細胞壁分解能が病態形成と薬剤耐性獲得に果たす役割の解明
- 2023 - 2026 1細胞解像度で紐解く不均質な細菌群集からの亜集団発生
- 2023 - 2026 腸内細菌による粘膜バリア制御機構の解明
- 2024 - 2026 新規PET分解菌のシングルセルゲノム情報に基づくPET代謝の理解と応用
- 2021 - 2024 シン・パレオゲノミクスが創る博物館資料群活用の新展開
- 2021 - 2024 シングルセルゲノムデータに基づく未培養微生物の戦略的資源化プロセスの開発
- 2019 - 2022 Elucidation of the molecular mechanism of immunotherapy treatment resistance by microtissue multidisciplinary sequence
- 2017 - 2022 Development of platform for ultra high-throughput screening of novel bioactive compound producers
- 2019 - 2021 Obtaining of complete genomes of uncultured microbes by sequencing of single-cell genomes without whole genome amplification
- 2018 - 2021 Integrated imaging and sequencing analysis to unravel the genome and transcriptional activation at the single-cell level
- 2015 - 2019 組織内の細胞多様性を明らかにする超並列ゲノム解析技術の創成
- 2014 - 2016 Development of single-cell whole genome amplification method for uncultivable bacteria using droplet microfluidics
- 2011 - 2016 Advanced Micro Fluidic Engineering and Its Applications for High Sensitive Quantitative Measurements of Biomolecules
- 2012 - 2015 Development of technique for digital counting of DNA copy number at the single-cell level
- 2011 - 2013 セルクロマトグラフィーによる循環腫瘍細胞の量的・質的評価法の開発
- 2009 - 2010 多孔質担体集積基板を利用した単一細胞の網羅的な遺伝子発現解析法の開発
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Papers (78)：
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Ryota Wagatsuma, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Haruko Takeyama. vClean: assessing virus sequence contamination in viral genomes. NAR genomics and bioinformatics. 2025. 7. 1. lqae185
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Tetsuro Kawano-Sugaya, Koji Arikawa, Tatsuya Saeki, Taruho Endoh, Kazuma Kamata, Ayumi Matsuhashi, Masahito Hosokawa. A single amplified genome catalog reveals the dynamics of mobilome and resistome in the human microbiome. Microbiome. 2024. 12. 1. 188-188
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Yohei Nishikawa, Ryota Wagatsuma, Yuko Tsukada, Lin Chia-Ling, Rieka Chijiiwa, Masahito Hosokawa, Haruko Takeyama. Large-scale single-virus genomics uncovers hidden diversity of river water viruses and diversified gene profiles. The ISME journal. 2024
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Takuya Yoda, Ayumi Matsuhashi, Ai Matsushita, Shohei Shibagaki, Yukie Sasakura, Kazuteru Aoki, Masahito Hosokawa, Soichiro Tsuda. Uncovering Endolysins against Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Using a Microbial Single-Cell Genome Database. ACS infectious diseases. 2024
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Masako Kifushi, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Keigo Ide, Masato Kogawa, Toyoaki Anai, Haruko Takeyama. Analysis of microbial dynamics in the soybean root-associated environments from community to single-cell levels. Journal of bioscience and bioengineering. 2024. 137. 6. 429-436
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MISC (19)：
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由良 敬, 松永 浩子, 細川 正人, 和泉 自泰, 村松 知成, 福永 津嵩, 浜田 道昭, 馬場 健史, 竹山 春子. 【あなたのラボから薬を生み出す アカデミア創薬の実践 All JAPAN体制の先端技術支援を利用した創薬の最前線】(第1章)最新の疾患標的分子の探索・評価技術 シングルセル/微小組織マルチオミクス解析. 実験医学. 2024. 42. 2. 199-204
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大西雄貴, 大西雄貴, 西川洋平, 西川洋平, 木伏真子, 木伏真子, 細川正人, 細川正人, 細川正人, 細川正人, et al. Genome analysis of soybeans root endophytic bacteria to identify plant growth-promoting bacteria. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2024. 76th
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大西雄貴, 大西雄貴, 西川洋平, 西川洋平, 木伏真子, 木伏真子, 細川正人, 細川正人, 細川正人, 細川正人, et al. Identification of soybean root endophytic core bacteria grown in different environments. 日本放線菌学会大会講演要旨集. 2024. 38th
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細川 正人. バイオものづくり 成功のためのコンパス. 生物工学会誌. 2023. 101. 7. 378-379
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細川正人, 細川正人, 津田宗一郎. 未培養微生物遺伝子の大規模データを活用した酵素探索. 酵素工学ニュ-ス. 2023. 90
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Patents (23)：
Books (2)：
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未培養微生物研究の最新動向
シーエムシー出版 2023 ISBN:9784781317328
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シングルセル解析でなにがわかるか
化学同人 2020 ISBN:9784759817348
Lectures and oral presentations (37)：
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統合シーケンス解析が切り拓くマイクロバイオーム研究 :メタゲノム・シングルセル・ロングリードシーケンスまで
(第4回腸内デザイン学会 2024)
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Single-Cell Genomics: Enhancing Microbiome Research and Biomanufacturing
(i-BioN 2024)
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大規模遺伝子データを活用したCO2からのバイオものづくり
(BioJapan 製品評価技術基盤機構 CO2を直接原料としたバイオものづくりへの挑戦 2024)
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大規模微生物遺伝子データの収集からものづくりへの展開
(バイオ関連化学シンポジウム若手フォーラム 2024)
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微生物遺伝子ビッグデータの可能性: バイオものづくりへの革新的アプローチ
(お茶の水女子大学 生物学科セミナー 2024)
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Education (1)：
- 2008 - 2010 Tokyo University of Agriculture and Technology
Professional career (1)：
- Doctor of Engineering (Tokyo University of Agriculture and Technology)
Work history (10)：
- 2022/04 - 現在 Japan Science and Technology Agency FOREST Researcher
- 2021/04 - 現在 Tokyo University of Agriculture and Technology Visiting Associate Professor
- 2021/04 - 現在 Waseda University Graduate School of Advanced Science and Engineering, Faculty of Science and Engineering Associate Professor
- 2018/11 - 現在 bitBiome, Inc. Director, CSO
- 2018/09 - 2020/03 Waseda University Research Institute for Science and Engineering Junior Researcher <Assistant Professor>
- 2015/10 - 2019/03 Japan Science and Technology Agency PRESTO Researcher
- 2014/04 - 2016/03 Waseda University Institute for Nanoscience and Nanotechnology Junior Researcher <Assistant Professor>
- 2013/06 - 2014/03 Waseda University Faculty of Science and Engineering Postdoctoral (PD) Research Fellowships
- 2011/04 - 2013/05 Shizuoka Cancer Center, Research Institute Postdoctoral (PD) Research Fellowships
- 2010/04 - 2011/03 Tokyo University of Agriculture and Technology Graduate School of Engineering Postdoctoral (PD) Research Fellowships
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Awards (6)：
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