Pat
J-GLOBAL ID：201603005022845600

遺伝子絞り込み装置、遺伝子絞り込み方法、及びコンピュータプログラム

Inventor：
水口賢司

About 水口賢司

, 
陳 怡安

About 陳 怡安

, 
ロケシュ・パティ・テリパチ

About ロケシュ・パティ・テリパチ


Applicant, Patent owner：
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所

About 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所


Agent (6)： 山本 秀策 ,  森下 夏樹 ,  ▲駒▼谷 剛志 ,  飯田 貴敏 ,  石川 大輔 ,  山本 健策
Gazette classification：特許公報
Application number (International application number)：2011184289
Publication number (International publication number)：2012069104
Patent number：5930266
Application date： Aug. 26, 2011
Publication date： Apr. 05, 2012
Claim (excerpt)：
【請求項1】教師付き学習も、正例及び負例もなしで、複数の候補遺伝子又は候補タンパク質から特定の機能又は性質に対する関連性を有する遺伝子又はタンパク質を絞り込む遺伝子絞り込み装置であって、 記憶手段と、入力手段と、処理手段とを備え、 前記記憶手段は、複数の生物学的情報が格納され、一の遺伝子又はタンパク質に前記情報から得られた複数のアノテーションが付与されたデータウェアハウスを記憶し、 前記入力手段は、複数の候補遺伝子又は候補タンパク質が情報として入力され、 前記処理手段は、 (a)前記記憶手段に記憶された前記データウェアハウスから、前記入力手段から入力された前記候補遺伝子又は前記候補タンパク質と相互作用する遺伝子又はタンパク質を収集し、前記相互作用する遺伝子又は前記タンパク質を候補遺伝子又は候補タンパク質として前記入力手段に追加して入力する再入力処理を実行する、再入力処理と (b)前記記憶手段に記憶された前記データウェアハウスから、前記入力手段から入力された前記候補遺伝子又は前記候補タンパク質に付与されたアノテーションを収集し、前記再入力処理により再入力された前記相互作用する遺伝子又はタンパク質に付与されたアノテーションを収集する収集処理と、 (c)前記収集処理で収集されたアノテーションの中から、前記入力手段から得られた前記候補遺伝子又は前記候補タンパク質および前記再入力処理により再入力された前記相互作用する遺伝子又はタンパク質における付与の頻度又は数が閾値より高いアノテーションを1又は複数選択する第1選択処理と、 (d)前記入力手段から得られた前記候補遺伝子又は前記候補タンパク質および前記再入力処理により再入力された前記相互作用する遺伝子又はタンパク質の中から、前記選択処理で選択されたアノテーションが付与された遺伝子又はタンパク質を選択する第2選択処理であって、ここで前記第2選択処理は、教師付き学習も、正例及び負例もなしで、前記選択処理で選択されたアノテーションが付与された遺伝子又はタンパク質が特定の機能又は性質に関連性を有するとみなす、 第2選択処理と、 を実行することを特徴とする、遺伝子絞り込み装置。
IPC (4)：
G06F 19/22 ( 201 1.01) ,  G06F 17/30 ( 200 6.01) ,  C12M 1/00 ( 200 6.01) ,  C12Q 1/68 ( 200 6.01)
FI (4)：
G06F 19/22 ,  G06F 17/30 170 F ,  C12M 1/00 A ,  C12Q 1/68 A
Patent cited by the Patent：
Cited by examiner (4)
Show all

Return to Previous Page

TOP

BOTTOM