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J-GLOBAL ID：201801000905389600   Update date: May. 22, 2023

Arakawa Takatoshi

Arakawa Takatoshi
Affiliation and department：
東京大学 大学院農学生命科学研究科

About 東京大学 大学院農学生命科学研究科


Job title： 助教
Other affiliations (1)：
  • 東京大学  微生物科学イノベーション科学連携研究機構 
Homepage URL  (1)： http://enzyme13.bt.a.u-tokyo.ac.jp
Research keywords  (8)： chemical engineering ,  enzymology ,  構造生物学 ,  bioprocess ,  enzyme ,  secondary metabolism ,  membrane proteins ,  protein engineering
Papers (52)：
  • Naomine Yano, Tatsuya Kondo, Katsuhiro Kusaka, Taro Yamada, Takatoshi Arakawa, Tatsuji Sakamoto, Shinya Fushinobu. Charge neutralization and β-elimination cleavage mechanism of family 42 L-rhamnose-α-1,4-D-glucuronate lyase revealed using neutron crystallography. bioRxiv. 2022
  • Shun Maruyama, Kota Sawano, Satoko Amaki, Takehiro Suzuki, Satoru Narita, Kenta Kimura, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Yukishige Ito, Naoshi Dohmae, et al. Substrate complex structure, active site labeling and catalytic role of the zinc ion in cysteine glycosidase. Glycobiology. 2022. 32. 2. 171-180
  • Toma Kashima, Kouki Okumura, Akihiro Ishiwata, Machika Kaieda, Tohru Terada, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Kentaro Shimizu, Katsunori Tanaka, Motomitsu Kitaoka, et al. Identification of difructose dianhydride I synthase/hydrolase from an oral bacterium establishes a novel glycoside hydrolase family. Journal of Biological Chemistry. 2021. 297. 5. 101324-101324
  • Tatsuya Kondo, Miyu Kichijo, Akiho Maruta, Makoto Nakaya, Shigeo Takenaka, Takatoshi Arakawa, Shinya Fushinobu, Tatsuji Sakamoto. Structural and functional analysis of gum arabic l-rhamnose-α-1,4-d-glucuronate lyase establishes a novel polysaccharide lyase family. Journal of Biological Chemistry. 2021. 101001-101001
  • Tatsuya Kondo, Miyu Kichijo, Makoto Nakaya, Shigeo Takenaka, Takatoshi Arakawa, Toshihisa Kotake, Shinya Fushinobu, Tatsuji Sakamoto. Biochemical and structural characterization of a novel 4-O-α-l-rhamnosyl-β-d-glucuronidase from Fusarium oxysporum. The FEBS journal. 2021. 288. 16. 4918-4938
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MISC (39)：
  • 矢野直峰, 近藤辰哉, 日下勝弘, 山田太郎, 荒川孝俊, 山田千早, 阪本龍司, 伏信進矢. Neutron structural analysis of rhamnose glucuronic acid lyase from Fusarium oxysporum 12S. 量子ビームサイエンスフェスタ(Web). 2022. 2021
  • 味木智子, 澤野孝太, 成田覚, 成田覚, 鈴木健裕, 荒川孝俊, 荒川孝俊, 山田千早, 山田千早, 堂前直, et al. Inhibitor-based studies on β-L-arabinofuranosidase. 量子ビームサイエンスフェスタ(Web). 2021. 2020
  • 鹿島騰真, 奥村公喜, 荒川孝俊, 山田千早, 石渡明弘, 伊藤幸成, 藤田清貴, 伏信進矢. カラメル化糖に作用するビフィズス菌の新規exo-α-D-fructofuranosidaseの構造解析. 応用糖質科学. 2021. 11. 2
  • 鹿島騰真, 奥村公喜, 荒川孝俊, 山田千早, 石渡明弘, 伊藤幸成, 藤田清貴, 伏信進矢. カラメル化糖に作用するビフィズス菌の新規exo-α-D-fructofuranosidaseの構造解析. 応用糖質科学. 2020. 10. 4
  • 佐藤優太, 安達成彦, 守屋俊夫, 荒川孝俊, 荒川孝俊, 川崎政人, 山田千早, 山田千早, 矢吹崇吏, 若木高善, et al. Near-atomic resolution cryo-EM single particle analysis of sulfur oxygenase reductase from Sulfolobus tokodaii. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2020. 2020
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Patents (5)：
Education (1)：
  • - 2007 Tokyo University of Agriculture and Technology Graduate School of Technology
Professional career (1)：
  • Ph.D.
Work history (4)：
  • 2013/04 - 現在 The University of Tokyo Graduate School of Agricultural and Life Sciences Assistant professor
  • 2012/04 - 2013/03 Kyoto University Graduate School of Medicine
  • 2007/11 - 2012/03 Kyoto University Graduate School of Medicine
  • 2007/04 - 2012/03 科学技術振興機構 ERATO岩田プロジェクト 研究員
Committee career (3)：
  • 2019/04 - 現在 日本農芸化学会 産学官学術交流委員会幹事
  • 2019/04 - 2021/03 KEK-PF(フォトンファクトリー) PFnews編集委員
  • 2018/04 - 2019/03 日本農芸化学会 2019年度大会実行委員
Association Membership(s) (6)：
THE CRYSTALLOGRAPHIC SOCIETY OF JAPAN ,  JAPAN SOCIETY FOR BIOSCIENCE, BIOTECHNOLOGY, AND AGROCHEMISTRY ,  PROTEIN SCIENCE SOCIETY OF JAPAN ,  THE JAPANESE BIOCHEMICAL SOCIETY ,  American Chemical Society ,  Japanese Society of Enzyme Engineering
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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