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J-GLOBAL ID:201803004247624725

微生物の判別方法

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (5): 特許業務法人アルガ特許事務所 ,  高野 登志雄 ,  中嶋 俊夫 ,  村田 正樹 ,  山本 博人
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2016172041
Publication number (International publication number):2018033430
Application date: Sep. 02, 2016
Publication date: Mar. 08, 2018
Summary:
【課題】レンズレスイメージングシステムを用いて、微生物コロニーの散乱光パターンから微生物を判別する方法の提供。【解決手段】フォトセンサを用いたレンズレスイメージングシステムを用いて微生物を判別する方法であって、フォトセンサ上に載置した培養容器中で、微生物を含むサンプルを培養し、培養期間中に形成されるコロニーを経時的に撮像する工程、複数のコロニー形成画像から抽出される特徴から、少なくともコロニー最大増殖速度μmax及び相対平均輝度Iを含む3種以上、又は少なくともヒストグラムの偏差G及びドーナツ性D、又はドーナツ性D及び画像エントロピーHを含む2種以上のパラメータを算出する工程、前記パラメータの値を、予め構築された既知微生物ごとに算出したパラメータのデータベースと照合・比較して微生物を特定する工程、を含む方法。【選択図】図1
Claim (excerpt):
フォトセンサを用いたレンズレスイメージングシステムを用いて微生物を判別する方法であって、 フォトセンサ上に載置した培養容器中で、微生物を含むサンプルを培養し、培養期間中に形成されるコロニーを経時的に撮像する工程、 複数のコロニー形成画像から抽出される特徴から、コロニー最大増殖速度μmax、コロニー可視化時間ta、相対平均輝度I、ヒストグラムの偏差G、ドーナツ性D、画像エントロピーH、画像エネルギー密度Ed、画像エネルギーE、重み付け中心の差異W、及び中心領域の平均輝度Cの10種のパラメータのうち、少なくともコロニー最大増殖速度μmax及び相対平均輝度Iを含む3種以上、又は少なくともヒストグラムの偏差G及びドーナツ性D、又はドーナツ性D及び画像エントロピーHを含む2種以上を算出する工程、 前記パラメータの値を、予め構築された既知微生物ごとに算出した当該パラメータのデータベースと照合・比較して微生物を特定する工程、を含む方法。
IPC (4):
C12Q 1/04 ,  C12M 1/34 ,  G01N 21/17 ,  G01N 33/48
FI (4):
C12Q1/04 ,  C12M1/34 B ,  G01N21/17 A ,  G01N33/48 M
F-Term (33):
2G045AA24 ,  2G045AA28 ,  2G045BB20 ,  2G045CB21 ,  2G045FA16 ,  2G045JA01 ,  2G059AA05 ,  2G059BB04 ,  2G059BB11 ,  2G059BB12 ,  2G059CC20 ,  2G059DD17 ,  2G059EE01 ,  2G059FF01 ,  2G059FF04 ,  2G059GG02 ,  2G059HH02 ,  2G059HH06 ,  2G059LL10 ,  2G059MM01 ,  2G059MM02 ,  4B029AA07 ,  4B029BB02 ,  4B029CC07 ,  4B029FA03 ,  4B029GA01 ,  4B029GB06 ,  4B029GB10 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ06 ,  4B063QS39 ,  4B063QX01
Patent cited by the Patent:
Cited by applicant (2) Cited by examiner (2)
Article cited by the Patent:
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