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J-GLOBAL ID：201902230704082356   Reference number：19A2813526

Methods for analyzing next-generation sequencing data XIV. RNA-seq analysis (Part 2)

次世代シーケンサーデータの解析手法 第14回 RNA-seq解析(その2)

Author (5)： TERADA TOMOKO (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SHIMIZU KENTARO (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SHIMIZU KENTARO (東大 微生物科学イノベーション連携研究機構) ,  KADOTA KOJI (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  KADOTA KOJI (東大 微生物科学イノベーション連携研究機構)
Material： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
Volume： 30  Issue： 3  Page： 153-161  Publication year： Nov. 13, 2019 
JST Material Number： L3534A  ISSN： 1343-327X  Document type： Article
Article type： 解説  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： *nucleotide sequence ,...
Semi thesaurus term： *next-generation sequencing ,...

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JST classification (4)： Research methods in genetics  (EC01020N) ,  Structure and chemistry of genes  (EC02020U) ,  Microorganism biochemistry  (EG03020N) ,  Molecular and genetic information processing  (JE15040B)

Reference (17)：

• 1) 寺田朋子,坂本光央,清水謙多郎,門田幸二(2019)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 13 回 RNA-seq 解析(その1).日本乳酸菌学会誌 30: 38-45.
• 2) Kankainen M, Paulin L, Tynkkynen S, von Ossowski I, Reunanen J, et al. (2009) Comparative genomic analysis of Lactobacillus rhamnosus GG reveals pili containing a human- mucus binding protein. Proc Natl Acad Sci U S A 106: 17193-17198.
• 3) Bang M, Yong CC, Ko HJ, Choi IG, Oh S. (2018) Transcriptional Response and Enhanced Intestinal Adhesion Ability of Lactobacillus rhamnosus GG after Acid Stress. J Microbiol Biotechnol 28: 1604-1613.
• 4) Toribio AL, Alako B, Amid C, Cerdeño-Tarrága A, Clarke L, et al. (2017) European Nucleotide Archive in 2016. Nucleic Acids Res 45: D32-D36.
• 5) Afgan E, Baker D, van den Beek M, Blankenberg D, Bouvier D, et al. (2016) The Galaxy platform for accessible, reproducible and collaborative biomedical analyses: 2016 update. Nucleic Acids Res 44: W3-W10.

Terms in the title (4)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  RNA-seq ,  解析