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J-GLOBAL ID：201902274487833142   Reference number：19A0611381

Methods for analyzing next-generation sequencing data: XIII. RNA-seq analysis (Part 1)

次世代シーケンサーデータの解析手法 第13回 RNA-seq解析(その1)

Author (6)： TERADA TOMOKO (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SAKAMOTO MITSUO (理研 バイオリソース研究セ) ,  SHIMIZU KENTARO (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SHIMIZU KENTARO (東大 微生物科学イノベーション連携研究機構) ,  KADOTA KOJI (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  KADOTA KOJI (東大 微生物科学イノベーション連携研究機構)
Material： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
Volume： 30  Issue： 1  Page： 38-45  Publication year： Mar. 14, 2019 
JST Material Number： L3534A  ISSN： 1343-327X  Document type： Article
Article type： 解説  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： *automatic analyser ,...
Semi thesaurus term： *Lactobacillus rhamnosus ,...

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JST classification (3)： Research methods in microbiology and virology in general  (EG02010V) ,  Research methods in genetics  (EC01020N) ,  Structure and chemistry of genes  (EC02020U)

Reference (28)：

• 1) 孫建強,三浦文,清水謙多郎,門田幸二(2015)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 3 回 Linux 環境構築から NGS データ取得まで.日本乳酸菌学会誌 26: 32-41.
• 2) 孫建強,湯敏,清水謙多郎,門田幸二(2015)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 4 回クオリティコントロールとプログラムのインストール.日本乳酸菌学会誌 26: 124-132.
• 3) 孫建強,清水謙多郎,門田幸二(2015)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 5 回アセンブル、マッピング、そして QC.日本乳酸菌学会誌 26: 193-201.
• 4) Broadbent JR, Neeno-Eckwall EC, Stahl B, Tandee K, Cai H, et al. (2012) Analysis of the Lactobacillus casei supragenome and its influence in species evolution and lifestyle adaptation. BMC Genomics 13: 533.
• 5) 門田幸二,孫建強,湯敏,西岡輔,清水謙多郎(2014)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 1 回イントロダクション.日本乳酸菌学会誌 25: 87-94.

Terms in the title (4)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  RNA-seq ,  解析