PDBjタンパク質をゲノムにマップしたpdbBAMの作成

Study period：2014 - 2014
Organization (1)：
Principal investigator： ( , 大学院医学系研究科, 助教 )
Research overview：

本研究では、PDBjに含まれる立体構造が解析されたタンパク質のアミノ酸配列について対応するmRNA配列に変換した後、ヒトゲノムDNA配列にマッピングし、ゲノム上の位置と変異情報を示すpdbBAMファイルを構築する。これにより、個人ゲノム解析結果をゲノムブラウザで閲覧したときに、変異情報と既知の構造情報を一目で把握することを可能にする。本研究は個人ゲノム解析と構造生物学の橋渡しをするものであり、これらの研究成果を個別化医療や創薬に効率的に応用できるツールを目指す。

, ,

Research program：＞＞
Parent Research Project： DICP Tool Prototype Trial for Integrated Database Analysis
Organization with control over the research：

Japan Science and Technology Agency

Reports ：

2014 Completion report

Return to Previous Page