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J-GLOBAL ID：201702254961596222   整理番号：17A0087964

tert-ブチルジメチルシリル誘導体化アミノ酸の衝突誘起解離のGC-MS/MSによる調査とEscherichia coliの中心代謝の¹³C-代謝フラックス分析へのその適用

GC-MS/MS survey of collision-induced dissociation of tert-butyldimethylsilyl-derivatized amino acids and its application to 13C-metabolic flux analysis of Escherichia coli central metabolism

著者 (6件)： Okahashi Nobuyuki (Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University, Suita, Osaka, Japan) ,  Kawana Shuichi (Analytical and Measuring Instruments Division, Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan) ,  Iida Junko (Analytical and Measuring Instruments Division, Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan) ,  Iida Junko (Osaka University Shimadzu Analytical Innovation Research Laboratory, Graduate School of Engineering, Osaka University, Suita, Osaka, Japan) ,  Shimizu Hiroshi (Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University, Suita, Osaka, Japan) ,  Matsuda Fumio (Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University, Suita, Osaka, Japan)
資料名： Analytical & Bioanalytical Chemistry  (Analytical & Bioanalytical Chemistry)
巻： 408  号： 22  ページ： 6133-6140  発行年： 2016年09月 
JST資料番号： E0425B  ISSN： 1618-2642  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 哺乳類,植物,及び微生物細胞中の炭素流動レベル(代謝フラックス)を調べるために,質量分析を利用する安定同位体標識実験が利用されてきた。より正確な¹³C-代謝フラックス分析(13C-MFA)を実現するために,tert-ブチルジメチルシリル(TBDMS)-アミノ酸の新規フラグメンテーションが,ガスクロマトグラフィー-タンデム質量分析(GC-MS/MS)によって調べられた。15個のTBDMS-アミノ酸のプロダクトイオンスキャン分析は,24個のシンクフラグメントイオンを明らかにした。5つのフラグメントイオン中に含まれるアミノ酸由来炭素が,¹³C-標識真正標準品の分析によって同定された。m/z 170でのフラグメントイオンの同定は,メチオニンのS-メチル炭素の同位体存在度が,[M-159]⁺(m/z 218)の前駆体中のC5の開裂から決定されることを示唆した。Escherichia coliの中心炭素代謝中の¹³C-MFAの精度が,新規フラグメンテーションからの¹³C-標識データの導入によって改良されることも確認された。Copyright 2016 Springer-Verlag Berlin Heidelberg Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： 標識法 ,  *炭素13 ,  *GC-MS分析 ,  *タンデム質量分析 ,  *衝突誘起解離 ,  アミノ酸 ,  *大腸菌 ,  フラグメンテーション ,  *誘導体化 ,  有機ケイ素化合物
準シソーラス用語： *GC-MS/MS分析 ,  安定同位体標識法 ,  *代謝フラックス解析

著者キーワード (5件)： 13C-metabolic flux analysis ,  GC-MS/MS ,  Fragmentation ,  Amino acids ,  Escherichia coli

分類 (2件)： 有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  代謝と栄養  (EG03054K)

引用文献 (23件)：

• Wiechert W. ¹³C metabolic flux analysis. Metab Eng. 2001;3(3):195-206.
• Antoniewicz MR. Using multiple tracers for ¹³C metabolic flux analysis. Methods Mol Biol. 2013;985:353-65.
• Antoniewicz MR. Methods and advances in metabolic flux analysis: a mini-review. J Ind Microbiol Biotechnol. 2015;42(3):317-25.
• Wittmann C. Fluxome analysis using GC-MS. Microb Cell Factories. 2007;6:6.
• Zamboni N, Fendt SM, Ruhl M, Sauer U. ¹³C-based metabolic flux analysis. Nat Protoc. 2009;4(6):878-92.

タイトルに関連する用語 (9件)： TERT ,  誘導体化 ,  アミノ酸 ,  衝突誘起解離 ,  GC-MS ,  調査 ,  Escherichia ,  代謝 ,  代謝フラックス分析