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J-GLOBAL ID：201702291701112089   整理番号：17A0322971

T3ループに位置する非活性部位残基の置換のエンドポリガラクトロナーゼ類の触媒効率を増加させた【Powered by NICT】

Substitution of a non-active-site residue located on the T3 loop increased the catalytic efficiency of endo-polygalacturonases

著者 (7件)： Tu Tao (Key Laboratory for Feed Biotechnology of the Ministry of Agriculture, Feed Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, PR China) ,  Pan Xia (Key Laboratory for Feed Biotechnology of the Ministry of Agriculture, Feed Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, PR China) ,  Meng Kun (Key Laboratory for Feed Biotechnology of the Ministry of Agriculture, Feed Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, PR China) ,  Luo Huiying (Key Laboratory for Feed Biotechnology of the Ministry of Agriculture, Feed Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, PR China) ,  Ma Rui (Key Laboratory for Feed Biotechnology of the Ministry of Agriculture, Feed Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, PR China) ,  Wang Yuan (Key Laboratory for Feed Biotechnology of the Ministry of Agriculture, Feed Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, PR China) ,  Yao Bin (Key Laboratory for Feed Biotechnology of the Ministry of Agriculture, Feed Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, PR China)
資料名： Process Biochemistry  (Process Biochemistry)
巻： 51  号： 9  ページ： 1230-1238  発行年： 2016年 
JST資料番号： C0250B  ISSN： 1359-5113  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： グリコシルヒドロラーゼ(GH)のエンドポリガラクツロナーゼ(PGs)ファミリー28はT1とT3ループにより形成された裂部と右巻き平行βヘリックス構造を共有している。PG触媒作用に及ぼす非活性部位残基の影響を明らかにするために,T3ループに位置するAchaetomium.PG(PG8fn)のThr113を置換した。実験結果はPG8fnの触媒効率は113位の残基の側鎖構造に依存しており,Glu(負に帯電した)<Gly,Ala及びIle(非極性)<Ser,Gln,Thr(極性)<Arg及びLys(正に帯電した),の順に従うことを示した。ボイド経路解析は,Argとの置換はボイド経路T2およびT3の増加した占有率を引き起こし,そして基板アクセス(k_on)または生成物放出(k_off)の反応速度を増加させることにより,触媒効率の改善をもたらすことを示した。さらに分子動力学(MD)シミュレーションは,置換はT3ループの柔軟性を高め,酵素と基質間の相互作用に影響することを示した。Arg113の機能的役割も~2.4倍の触媒効率を増加させることにより他のGH28PGで検証した。本研究は,非活性部位残基の選択的修飾,GH28PGsの触媒性能を改善するための新しい戦略を提案した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ペクチナーゼ ,  柔軟性 ,  非極性 ,  触媒活性 ,  反応速度 ,  極性 ,  分子動力学 ,  基質 ,  占有率 ,  グリコシド結合ヒドロラーゼ ,  側鎖 ,  *活性部位
準シソーラス用語： 触媒作用 ,  *触媒効率 ,  *残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： エンドポリガラクツロナーゼ(エンド-PG) ,  非活性部位残基 ,  部位特異的変異誘発 ,  触媒効率 ,  分子動力学(MD)

分類 (3件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  酵素の応用関連  (EB09100B) ,  酵素生理  (EG03052C)

タイトルに関連する用語 (6件)： T3 ,  ループ ,  活性部位 ,  残基 ,  置換 ,  触媒効率