アフリカ人祖先の男性におけるより高い前立腺癌リスクの基礎をなしている非コード遺伝的変異【JST機械翻訳】

Li, S.; Fatema, K.; Nidharshan, S.; Singh, A.; Rajagopal, P. S.; Notani, D.; Takeda, D.; Hannenhalli, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202402209839344428 整理番号：24P0276092

アフリカ人祖先の男性におけるより高い前立腺癌リスクの基礎をなしている非コード遺伝的変異【JST機械翻訳】

Non-coding genetic variants underlying higher prostate cancer risk in men of African ancestry

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発行年： 2024年11月15日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2024年11月15日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント言語：英語 (EN)

前立腺癌(PrCa)の発生率と重症度は,祖先全体で実質的に異なる。アフリカ人祖先(AA)のアメリカ人男性はヨーロッパ人祖先(EA)よりもPrCaと診断され死亡する可能性が高い。前立腺癌を発症する公表多遺伝子リスクスコアは,多祖先ゲノムワイド関連研究に基づくものでさえ,アフリカ系男性のPrCaリスクの基礎となる集団特異的遺伝的機構に対応していない。特に,PrCaの祖先間変動の駆動における非コード調節多型の役割は十分に探索されていない。ここでは,前立腺調節エンハンサーの配列に基づく深い学習モデルを用い,実験的検証により支持されるように,PrCa感受性と関係したエンハンサー機能に影響する可能性のある,AA男性でより高い対立頻度を示す,697:2,000 SNPsを同定した。同定したエンハンサーSNP(eSNP)は,2種類の相補的な機構を介しPrCa発達に影響する。1)エンハンサー活性を増加する別の対立遺伝子は,免疫抑制とテロメア伸長を生じ,2)エンハンサー活性を低下する別の対立遺伝子は,脱分化とアポトーシスの阻害を生じる。特に,eSNPはFOX,ARおよびHOXファミリーを含む既知の前立腺転写因子の結合を破壊する傾向がある。最後に,同定したeSNPは,独立したコホートでのPrCaリスクの評価で,現在のGWASに基づくリスク変異体に価値を加える,多遺伝子リスクスコアに組み合わせることができる。【JST機械翻訳】

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集団遺伝学

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