ヒトおよびマウスのmiRNAおよびそのプロモーターの総合的発現アトラス

DE RIE Derek; ABUGESSAISA Imad; ARNER Erik; BERTIN Nicolas; BURROUGHS A Maxwell; DAUB Carsten O; DEVIATIIAROV Ruslan; FORT Alexandre; HARSHBARGER Jayson; HASEGAWA Akira; HASHIMOTO Kosuke; HON Chung Chau; ISHIZU Yuri; KASUKAWA Takeya; LASSMANN Timo; LIZIO Marina; NOMA Shohei; SEVERIN Jessica; SHIN Jay W; TARUI Hiroshi; YASUZAWA Kayoko; KAWAJI Hideya; CARNINCI Piero; FORREST Alistair R R; DE HOON Michiel J L; DE RIE Derek; ALAM Tanvir; ASHOOR Haitham; HAYASHIZAKI Yoshihide; ARNER Peter; ASTROEM Gaby; MEJHERT Niklas; BABINA Magda; GUHL Sven; BERTIN Nicolas; BURROUGHS A Maxwell; CARLISLE Ailsa J; SUMMERS Kim M; DETMAR Michael; ROUDNICKY Filip; DEVIATIIAROV Ruslan; GEBHARD Claudia; REHLI Michael; GEBHARD Claudia; REHLI Michael; GOLDOWITZ Daniel; HA Thomas J; LECELLIER Charles-Henri; MATHELIER Anthony; ZHANG Peter G; HERLYN Meenhard; SWOBODA Rolf K; HEUTINK Peter; RIZZU Patrizia; HITCHENS Kelly J; HUANG Edward; WELLS Christine A; HUANG Edward; WELLS Christine A; KAI Chieko; SATO Hiroki; YONEDA Misako; KLINKEN Peter; WINTERINGHAM Louise; FORREST Alistair R R; LASSMANN Timo; LECELLIER Charles-Henri; LEE Weonju; MAKEEV Vsevolod; MEDVEDEVA Yulia A; MAKEEV Vsevolod; MAKEEV Vsevolod; MEDVEDEVA Yulia A; MEDVEDEVA Yulia A; MUNGALL Christopher J; OHSHIMA Mitsuhiro; OKADA-HATAKEYAMA Mariko; OKADA-HATAKEYAMA Mariko; YUMOTO Noriko; PERSSON Helena; SAETROM Pal; TOYODA Hiroo; VITTING-SEERUP Kristoffer; SANDELIN Albin; YAMAGUCHI Yoko; ZABIEROWSKI Susan; SUMMERS Kim M; KAWAJI Hideya; HAYASHIZAKI Yoshihide

文献

J-GLOBAL ID：201702267263543800 整理番号：17A1109340

ヒトおよびマウスのmiRNAおよびそのプロモーターの総合的発現アトラス

An integrated expression atlas of miRNAs and their promoters in human and mouse

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資料名：
巻： 35 号： 9 ページ： 872-878 発行年： 2017年09月
JST資料番号： H0870A ISSN： 1087-0156 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

マイクロRNA(miRNA)は短鎖非コードRNAであり,主として細胞制御を担う。我々は,FANTOM5(Functional Annotation of Mammalian Genome5)プロジェクトの一環として,ヒトRNAサンプル396点およびマウスRNAサンプル47点に由来するCAGE(Cap Analysis Gene Expression)法のデータと同じ492セットの短鎖RNA(sRNA)ライブラリーで高性能塩基配列解読を行い,miRNAおよびそのプロモーターの総合的発現アトラスを作製した。1357個のヒトmiRNAおよび804個のマウスmiRNAに関してプロモーターが見つかり,種間で強い配列保存が認められた。さらに,初期miRNAのレベルと成熟miRNAのレベルは相関していて,合計1829セットのヒトCAGEライブラリーおよび1029セットのマウスCAGEライブラリーで,成熟miRNAレベルの代替値として初期miRNA測定値が利用可能であることが分かった。以上により,初代哺乳類細胞のmiRNA発現およびプロモーターに関する広範囲のアトラスが作製され,miRNA発現パターンおよび転写制御領域の詳細な解析の基盤が確立された。Copyright Nature Japan KK 2017

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遺伝子発現

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