特許
J-GLOBAL ID：201503017103046630
質量分析を用いた修飾タンパク質同定方法及び同定装置
発明者：
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出願人/特許権者：
代理人 (1件)：
特許業務法人京都国際特許事務所
公報種別：特許公報
出願番号（国際出願番号）：特願2011-185711
公開番号（公開出願番号）：特開2013-047624
特許番号：特許第5776443号
出願日： 2011年08月29日
公開日（公表日）： 2013年03月07日
請求項（抜粋）：
【請求項1】起こり得る可能性のある翻訳後修飾を検索条件の一つとして設定することで翻訳後修飾を受けた修飾タンパク質を同定することが可能であるアミノ酸配列同定用の検索エンジンを利用し、MSn分析(n≧1)により収集された質量分析データに基づいて被検試料中の修飾タンパク質を同定する、質量分析を用いた修飾タンパク質同定方法であって、
既知であるタンパク質のアミノ酸配列情報及び翻訳後修飾情報に基づいて作成された、修飾を受けたアミノ酸を擬似的な一つのアミノ酸とみなして所定の規則に則って記号化された既知の修飾タンパク質のアミノ酸配列を含む修飾タンパク質データベースを使用し、
前記アミノ酸配列同定用の検索エンジンを用い翻訳後修飾がないとの条件の下で、与えられた質量分析データに基づくプロダクトイオン情報を前記修飾タンパク質データベースに含まれるそれぞれのアミノ酸配列から生成された対応するプロダクトイオン情報と照合することによってアミノ酸配列の候補を抽出し、
その抽出されたアミノ酸配列候補に基づいて、前記擬似的な一つのアミノ酸とみなされた修飾を受けたアミノ酸については非修飾のアミノ酸に対応した記号に戻した上で、アミノ酸配列、修飾部位、修飾の種類を含む情報を出力することを特徴とする質量分析を用いた修飾タンパク質同定方法。
IPC (1件)：
FI (2件)：
G01N 27/62 D
, G01N 27/62 V
出願人引用 (5件)
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審査官引用 (5件)
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