文献

J-GLOBAL ID：201702233295112653   整理番号：17A0307740

糸状菌における環状リボソームペプチド合成遺伝子のクラス【Powered by NICT】

Class of cyclic ribosomal peptide synthetic genes in filamentous fungi

著者 (17件)： Nagano Nozomi (Biotechnology Research Institute for Drug Discovery, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Nagano Nozomi (Computational Biology Research Consortium (CBRC), 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Umemura Myco (Bioproduction Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 17-2-1 Higashi-Nijo, Tsukisamu, Toyohira-ku, Sapporo, Hokkaido 062-8517, Japan) ,  Izumikawa Miho (Japan Biological Informatics Consortium, 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Kawano Jin (Bioproduction Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 17-2-1 Higashi-Nijo, Tsukisamu, Toyohira-ku, Sapporo, Hokkaido 062-8517, Japan) ,  Ishii Tomoko (Technology Research Association of Highly Efficient Gene Design, 17-2-1 Higashi-Nijo, Tsukisamu, Toyohira-ku, Sapporo, Hokkaido 062-8517, Japan) ,  Kikuchi Moto (Technology Research Association of Highly Efficient Gene Design, 17-2-1 Higashi-Nijo, Tsukisamu, Toyohira-ku, Sapporo, Hokkaido 062-8517, Japan) ,  Tomii Kentaro (Biotechnology Research Institute for Drug Discovery, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Tomii Kentaro (Computational Biology Research Consortium (CBRC), 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Kumagai Toshitaka (Fermlab, Inc., 4-3-1-913 Shirakawa, Koto-ku, Tokyo 135-0021, Japan) ,  Yoshimi Akira (New Industry Creation Hatchery Center, Tohoku University, 6-6-10 Aoba, Aramaki, Aoba-ku, Sendai 980-8579, Japan) ,  Machida Masayuki (Bioproduction Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 17-2-1 Higashi-Nijo, Tsukisamu, Toyohira-ku, Sapporo, Hokkaido 062-8517, Japan) ,  Abe Keietsu (New Industry Creation Hatchery Center, Tohoku University, 6-6-10 Aoba, Aramaki, Aoba-ku, Sendai 980-8579, Japan) ,  Shin-ya Kazuo (Biotechnology Research Institute for Drug Discovery, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Asai Kiyoshi (Biotechnology Research Institute for Drug Discovery, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Asai Kiyoshi (Computational Biology Research Consortium (CBRC), 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Asai Kiyoshi (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, 5-1-5 Kashiwanoha, Kashiwa, Chiba 277-8561, Japan)
資料名： Fungal Genetics and Biology  (Fungal Genetics and Biology)
巻： 86  ページ： 58-70  発行年： 2016年01月 
JST資料番号： W0857A  ISSN： 1087-1845  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウスチロキシン類は最近リボソーム糸状菌で合成した環状ペプチド二次代謝産物の最初の例であることが分かった。本研究では,Aspergillus flavusからウスチロキシン類に対する遺伝子クラスターが未定の二遺伝子(ustYa/ustYb)はペプチドの環化に関与していることが実験的に見出された。それらの相同遺伝子は主に糸状菌とキノコで観察された。は活性サイトを形成することを二「HXXHC」モチーフを持っている。計算ゲノム解析は,ウスチロキシン遺伝子クラスターで観察されたように,特にAspergillus,これらの遺伝子はしばしばリボソームペプチド前駆体,環状部分のコアペプチドとN末端と反復配列でシグナルペプチドを持つ候補遺伝子近くに位置する,糸状菌のゲノムであることを示した。ustYa/ustYb相同遺伝子とその周辺リボソームペプチド前駆体候補遺伝子の組合せに基づいて,Aspergillusゲノム配列から計算機的に同定された 94リボソームペプチド前駆体候補は,多種多様なコアペプチド配列を含む40種類以上に分類した。予測リボソームペプチド生合成遺伝子のセットを,対応する前駆体遺伝子のアミノ酸配列,ウスチロキシン前駆体から異なるから成る新しい環状ペプチド化合物,asperipin 2aと命名,を合成するために実験的に検証した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： Aspergillus ,  *リボソーム ,  シクロペプチド ,  アミノ酸配列 ,  *ペプチド ,  *ペプチド合成 ,  ゲノム ,  活性部位 ,  二次代謝産物 ,  *遺伝子 ,  *糸状菌類 ,  シグナルペプチド ,  Aspergillus flavus
準シソーラス用語： 黄色麹菌 ,  ゲノム配列 ,  遺伝子クラスタ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： リボソームペプチド合成経路 ,  Aspergilli ,  二次代謝産物 ,  ゲノム分析

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  代謝と栄養  (EG03054K)

タイトルに関連する用語 (4件)： 糸状菌 ,  環状 ,  合成遺伝子 ,  クラス